中国西藏近缘野生大麦5S rDNA NTS序列分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 谭睿
作者: 谭睿;马得泉;丁毅
作者机构:
关键词: 西藏野生大麦;5S核糖体DNA;非转录间隔区(NTS)
期刊名称: 遗传学报
ISSN: 0379-4172
年卷期: 2005 年 32 卷 10 期
页码: 1094-1100
收录情况: SCI ; 北大核心 ; CSCD
摘要: 选取来自西藏不同地理区域的17份近缘野生大麦材料和1份国外的近缘野生大麦材料,利用直接PCR、T-载体转化克隆、克隆产物测序的方法获得了它们的5S核糖体DNA NTS(Nontranscribed intergenic spacer)序列。对这些序列进行测定、分析和比较,构建了分子系统树。结果表明,西藏近缘野生大麦NTS序列包括两段相对保守的保守区A和保守区B以及一段变异较大的变异区V,变异区由若干个TAG碱基的重复序列构成。两段保守区总长度为168~169bp,长度变异较小,仅相差1bp。保守区的GC%含量为43.8%,其中有12个核甘酸位点发生变异(占总核甘酸数目的7.1%),变异位点基本上是颠换多于转换,颠换/转换率为1.0~2.0。变异区中TAG重复序列的重复次数从4到17次,而且有部分TAG重复发生了颠换和转换(TAG→TCG,TAG→TAC)。TAG重复序列的多态性是决定NTS序列多态性的主要因素。对西藏近缘野生大麦和麦属其他作物的比较,认为rDNA NTS适合作为属内分类的分子标记。
分类号: S512.3
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