辣椒果色全基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张小微

作者： 张小微;陈小翠;陈仕泽;覃成;杨红;唐相群;邱化荣;罗希榕

作者机构：

关键词： 辣椒;果色;SNP;全基因组关联分析;候选基因

期刊名称： 植物遗传资源学报

ISSN： 1672-1810

年卷期： 2023 年 003 期

页码： 843-853

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 辣椒果色作为辣椒重要的农艺性状直接影响辣椒商品价值，其遗传机制的解析可对辣椒果实外观品质改良提供指导。本研究利用全基因组关联分析（GWAS）挖掘辣椒果色显著关联的SΝP位点及候选基因。以195份一年生辣椒构成的自然群体为试验材料，分别在2020年和2021年调查辣椒果色（青果色和熟果色）性状，通过DNA测序和SNP变异检测，质控得到的高质量SNP位点用于GWAS分析。结果表明：两年间辣椒果色性状表型完全一致，性状遗传稳定，其中青果色为绿的分布频率最高，达89.74%，熟果色为鲜红的分布频率最高，达60.51%;GWAS分析后共筛选出8个与辣椒果色相关的SNPs，这些位点分布在0、1、3、4号等4条染色体上；对显著SNP位点进行LD block分析并筛选候选基因，共注释到31个基因，预测呼吸爆发氧化酶同源蛋白A（Capana01g000138）、类异黄酮2′-羟化酶（Capana04g000616、Capana04g000617、Capana04g000618、Capana04g000619、Capana04g000620、Capana04g000621和Capana04g000622）和F-box-like/WD重复类蛋白TBL1Y（Capana04g000624）可能与辣椒果色相关。这些结果将为开展辣椒果色相关分子辅助育种提供参考依据。

分类号： S641.3

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