辣椒果色全基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张小微

作者： 张小微;陈小翠;陈仕泽;覃成;杨红;唐相群;邱化荣;罗希榕

作者机构：

关键词： 辣椒;果色;SNP;全基因组关联分析;候选基因

期刊名称： 植物遗传资源学报

ISSN： 1672-1810

年卷期： 2023 年 003 期

页码： 843-853

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 辣椒果色作为辣椒重要的农艺性状直接影响辣椒商品价值，其遗传机制的解析可对辣椒果实外观品质改良提供指导。本研究利用全基因组关联分析（GWAS）挖掘辣椒果色显著关联的SΝP位点及候选基因。以195份一年生辣椒构成的自然群体为试验材料，分别在2020年和2021年调查辣椒果色（青果色和熟果色）性状，通过DNA测序和SNP变异检测，质控得到的高质量SNP位点用于GWAS分析。结果表明：两年间辣椒果色性状表型完全一致，性状遗传稳定，其中青果色为绿的分布频率最高，达89.74%，熟果色为鲜红的分布频率最高，达60.51%;GWAS分析后共筛选出8个与辣椒果色相关的SNPs，这些位点分布在0、1、3、4号等4条染色体上；对显著SNP位点进行LD block分析并筛选候选基因，共注释到31个基因，预测呼吸爆发氧化酶同源蛋白A（Capana01g000138）、类异黄酮2′-羟化酶（Capana04g000616、Capana04g000617、Capana04g000618、Capana04g000619、Capana04g000620、Capana04g000621和Capana04g000622）和F-box-like/WD重复类蛋白TBL1Y（Capana04g000624）可能与辣椒果色相关。这些结果将为开展辣椒果色相关分子辅助育种提供参考依据。

分类号： S641.3

  • 相关文献

[1]小麦根部耐盐性状全基因组关联分析. 时晓磊,严勇亮,石书兵,王继庆,谢磊,张金波,耿洪伟. 2021

[2]特克赛尔羊*阿勒泰羊F2绵羊肉质嫩度全基因组关联分析. 赵义龙,黄金凤,贺三刚,刘明军. 2024

[3]甘蓝型油菜株高性状的全基因组关联分析. 唐敏强,程晓晖,童超波,刘越英,赵传纪,董彩华,于景印,马小艮,黄军艳,刘胜毅. 2015

[4]玉米叶片硝酸盐积累性状的全基因组关联分析. 邬奇,孙扬名,桑俊伟,周玲,赵涵. 2024

[5]辣椒果实主要品质性状遗传和代谢物组成研究进展. 张正海,曹亚从,于海龙,王立浩,张宝玺. 2019

[6]辣椒绿熟期果色及主要色素含量的遗传. 张宝玺,郭家珍,杨桂梅,徐光,东惠茹. 1996

[7]辣椒果色相关研究进展. 宋钊,夏碧波,李颖,张白鸽,徐小万,程蛟文,曹健,胡开林. 2018

[8]陆地棉自然群体纤维强度性状的全基因组关联分析. 贾冰,贾冰,马建江,宋吉坤,裴文锋,吴嫚,臧新山,张金发,陈全家,于霁雯. 2021

[9]南阳牛生长性状相关基因组区域全基因组关联分析. 吕世杰,陈付英,张子敬,施巧婷,辛晓玲,楚秋霞,李文军,柏中林,王二耀,徐照学. 2020

[10]代表性春大豆种质资源叶片蔗糖含量全基因组关联分析. 王象然,张大勇,郑伟,张振宇,徐杰飞,赵星棋,孙长恒,吴雨恒. 2024

[11]番茄抗旱性的全基因组关联分析. 董舒超,洪骏,凌嘉怡,谢紫欣,张胜军,赵丽萍,宋刘霞,王银磊,赵统敏. 2024

[12]基于全基因组关联分析揭示肉鸡腿病发生的遗传机制. 唐鑫鑫,郑炬梅,骆娜,营凡,朱丹,李森,刘大伟,安炳星,文杰,赵桂苹,李和刚. 2024

[13]大豆籽粒Ve含量的全基因组关联分析. 张红梅,张威,王琼,贾倩茹,孟珊,熊雅文,刘晓庆,陈新,陈华涛. 2024

[14]番茄群体果实光泽度评价及全基因组关联分析. 董舒超,张静雯,凌嘉怡,洪骏,谢紫欣,张胜军,宋刘霞,王银磊,赵统敏,赵丽萍. 2024

[15]小麦萌发期耐盐性全基因组关联分析. 库尼都孜阿依·吐尔汗,颜安,阿不都克玉木·米吉提,严勇亮,任毅,时晓磊,耿洪伟. 2021

[16]茶树苯乙醇樱草糖苷含量相关遗传位点的挖掘. 张力岚,杨军,王让剑. 2024

[17]玉米穗行数全基因组关联分析. 张焕欣,翁建峰,张晓聪,刘昌林,雍洪军,郝转芳,李新海. 2014

[18]利用全基因组关联分析挖掘高粱单宁新调控遗传位点. 张丽霞,王春语,于淼,陈冰嬬,陆晓春. 2023

[19]棉籽大小数量性状核苷酸定位及候选基因初步筛选. 乔丹,白冰楠,葛群,刘小芳,栾玉娟,牛皓,龚举武,巩万奎,闫浩亮,李俊文,刘爱英,石玉真,Elsamman Elameer,陈全家,袁有禄. 2024

[20]大豆R6期籽粒氨基酸含量的全基因组关联分析. 张红梅,熊雅文,许文静,张威,王琼,刘晓庆,刘慧,崔晓艳,陈新,陈华涛. 2023

作者其他论文 更多>>

微信小程序