玉米AFLP指纹图谱的引物选择研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张春庆

作者： 张春庆;贾继增

作者机构：

关键词： 玉米;指纹;AFLP;引物选择

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2002 年 28 卷 02 期

页码： 221-226

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： AFL P分子标记技术将对玉米品种指纹文库的构建发挥巨大作用 ,因此对玉米 AFL P指纹图谱的引物选择研究具有重要意义。通过研究发现 :1用 Mse 和 Eco R 酶切后 ,酶切位点后第一个碱基 T占的比例高达 30 %左右 ,其次 A占 2 7%左右 ,G、C占的比例较少 ,为 2 1%左右。第二个碱基 T占 2 7%左右 ,A、G、C分别占 2 4 %左右较均匀。因此以 TT选择引物时扩增的谱带较多。 2不同引物扩增的谱带的多态性不同 ,多态性强的引物组合可分为两类。其一为多态性主要由一端引物产生的 ;其二为多态性由两端共同决定的。对多态性贡献较大的两个引物组合可能产生更高的多态性。 3随引物选择碱基的增加 ,扩增的谱带数有所降低。同时增加一个选择碱基 ,在 M端增加一个选择碱基较在 E端增加一个选择碱基 ,谱带数目降低较多。 4在多态性较高的 2 +2引物组合中 ,增加第 3个选择碱基 ,可选出多态性更强的引物组合。 5选择多态性强的引物组合可按如下程序 :第一步选择 2～ 4组亲缘关系相近的材料 6～ 12个。第二步 ,将两端碱基相同的 2 +2引物组合 (16对 )全部选择扩增 ,以筛选有多态性的 2 +2引物组合。第三步 ,重组有多态的 2+2引物 ,以筛选多态性较强的 2 +2引物。第四步 ,将多态性较强的 2 +2引物一端分别增加第 3个选择碱基 ,?

分类号： S513.032

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