副猪嗜血杆菌中毒素蛋白基因hipA的生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 车勇良

作者: 车勇良;陈如敬;王隆柏;吴学敏;刘玉涛;王晨燕;周伦江

作者机构:

关键词: 副猪嗜血杆菌;毒素蛋白;HipA蛋白;生物信息学

期刊名称: 中国农学通报

ISSN: 1000-6850

年卷期: 2016 年 32 卷 02 期

页码: 1-4

收录情况: CSCD

摘要: 为预测毒素蛋白HipA的二级结构和B细胞抗原表位,首先从GenBank中查找副猪嗜血杆菌毒素蛋白基因hip A的序列,应用生物信息学方法,对副猪嗜血杆菌毒素蛋白HipA的理化性质、二级结构和B细胞抗原表位进行预测。结果显示,HipA蛋白的理论等电点为7.23,前50个氨基酸为信号肽,二级结构的预测结果显示该酶主要以α螺旋、无规则卷曲和延伸链为主,只有少数的β转角;推测该蛋白有17个B细胞优势抗原表位区域。该研究为进一步研究分析副猪嗜血杆菌毒素蛋白HipA的功能奠定理论基础。

分类号: S852.61

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