芒果炭疽病菌小柱孢酮脱水酶基因SCD1的克隆与敲除载体构建

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘娅楠

作者： 刘娅楠;蒲金基;张贺;周芳雪;杨永利;张恺莉;刘晓妹

作者机构：

关键词： 芒果;胶孢炭疽菌;小柱孢酮脱水酶基因SCD1;克隆;敲除载体

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2017 年 03 期

页码： 894-899

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 芒果炭疽病(Colletotrichum gloeosporioides)是为害芒果的重要病害之一,为了明确小柱孢酮脱水酶基因SCD1与芒果炭疽病菌致病力之间的相互关系,本研究以芒果炭疽病菌DNA为模板,利用同源克隆技术扩增SCD1,分析其序列特征、推测了其蛋白的保守结构域,并借助In-Fusion~ HD Cloning Kit技术进行敲除载体构建。结果表明,该基因DNA和cDNA全长分别为796 bp、564 bp,编码区有两个内含子(大小为52 bp,180 bp),推测编码187个氨基酸,其分子量约为21.52 kD,等电点PI为5.90,与NCBI网站中已公布的基因进行Blastp比对,发现该序列与香蕉炭疽菌(C.musae)、无花果炭疽菌(C.caricae)(登录号:GQ266389.1,GQ266386.1)的小柱孢酮脱水酶基因相似性分别为98%和97%。该基因的敲除载体pSCDGH-1已构建成功,为下一步获得SCD1基因敲除突变体,研究该基因功能打下了材料基础。

分类号： S436.67

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