不同TAIL-PCR通用引物在转基因大豆、水稻、油菜侧翼序列分离中的应用评价

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈笑芸

作者： 陈笑芸;汪小福;刘仁虎;张小明;周育;缪青梅;徐俊锋

作者机构：

关键词： TAIL-PCR;简并引物;转基因大豆;转基因水稻;转基因油菜;侧翼序列

期刊名称： 核农学报

ISSN： 1000-8551

年卷期： 2013 年 27 卷 07 期

页码： 922-928

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为研究不同转基因作物T-DNA插入位点侧翼序列分离中所用的通用简并引物对TAIL-PCR的影响,本研究使用5个通用简并引物分别对8个转基因大豆、30个转基因水稻和2个转基因油菜株系进行了TAIL-PCR分析,结果表明,5个简并引物在TAIL-PCR中的扩增效果存在显著差异,同一简并引物在不同转基因物种的扩增效果显著不同。AD1引物在转基因水稻和转基因油菜中扩增效果较好,AD2引物在转基因水稻、油菜和转基因大豆中扩增效果均较好,AD3引物在转基因水稻中扩增出1个株系,在转基因油菜中扩增出1个株系,但AD3引物与pFGC5941 T-DNA RB上游有匹配,不适用于以pFGC5941为载体的转基因材料分析。AD4和AD5 2个引物在3个转基因物种的扩增均较差。对AD1和AD2两个引物的TAIL-PCR扩增产物进行测序,结果表明,扩增产物均对应转基因材料的侧翼序列。研究表明,不同通用引物在不同转基因事件中侧翼序列的分离效果差异较大,通用引物AD1和AD2TAIL-PCR成功率最高。不同通用引物的应用效果不仅与不同物种有关,也与外源基因的插入位点有关,而且还与载体序列匹配程度相关。为提高TAIL-PCR中T-DNA插入位点侧翼序列分离成功率,建议同时采用多个通用引物平行扩增。

分类号： S565.1`S511`S565.4

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