大菱鲆(Scophthalmus maximus)微卫星序列的开发与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李猛

作者： 李猛;马爱军;岳亮;邹杰;王广宁;田岳强;马本贺;夏丹丹

作者机构：

关键词： 大菱鲆;微卫星标记;标记开发;序列分析;标记初筛

期刊名称： 海洋与湖沼

ISSN： 0029-814X

年卷期： 2013 年 44 卷 05 期

页码： 1365-1371

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用FIASCO(Fast Isolation by AFLP of Sequences Containing repeats)法和标记初步筛选法,进行了大菱鲆(Scophthalmus maximus)微卫星标记开发的研究,分析了大菱鲆基因组中微卫星DNA序列的特征,并进行了拟作图标记的初步筛选。结果表明,FIASCO法的富集效率为78.56%,二次筛选出655个阳性克隆,测序后经分析有469条含有微卫星位点的单一序列,共得到597个微卫星位点。其中完美型占51.76%,非完美型占34.67%,复合型占13.57%;核心序列的重复次数在3—96次之间,平均重复数为13.39次;重复单元类别最多的是(CA/GT)n,占77.6%。利用Primer Premier 5.0共设计413对引物,其中有360对能够得到稳定表达的产物;再经标记初筛试验得知,183对引物(50.8%)的PCR产物有多态性,其中110个微卫星位点(30.6%)符合遗传连锁图谱作图标准。

分类号： S917.4

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