羊口疮病毒E3L蛋白亚细胞定位及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 蒙泽菁

作者： 蒙泽菁;房永祥;贾怀杰;高真贞;陈国华;何小兵;景志忠;王晓霞

作者机构：

关键词： 羊口疮病毒;基因克隆;亚细胞定位;生物信息学

期刊名称： 中国病原生物学杂志

ISSN： 1673-5234

年卷期： 2023 年 002 期

页码： 141-146

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 目的 克隆羊口疮病毒020基因，构建其重组真核表达质粒并转染HeLa细胞，分析020基因编码E3L蛋白的亚细胞定位，分析该蛋白生物信息学特征。方法 提取羊口疮病毒基因组，PCR扩增020基因并构建重组真核表达质粒，转染HeLa细胞，采用Western blot检测其在该细胞中的表达，免疫荧光法检测该蛋白的亚细胞定位。利用DNAstar软件分析不同毒株ORFV E3L氨基酸序列特点及其遗传演化关系；利用SOMPA软件分析其二级结构；利用SignalP4.0软件预测信号肽；利用TMHMM2.0软件预测跨膜结构；利用NetPhos 3.1预测磷酸化位点；利用NetNGlyc-1.0预测糖基化位点；应用IDEB和SYFPEITHI预测ORFV E3L蛋白的抗原表位。结果 成功克隆得到ORFV 020基因，全长549 bp,编码183个氨基酸；亚细胞定位显示该蛋白定位于细胞核和细胞质。生物信息学分析ORFV E3L蛋白α螺旋约占40.44%、β折叠约占5.46%、延伸链约占16.94%、无规则卷曲约占37.16%;该蛋白无信号肽和跨膜结构，可能存在15个磷酸化位点，7个N-糖基化位点，5个B细胞线性表位，2个CTL表位，3个Th细胞表位，3个B细胞和CTL联合表位，3个B细胞和Th细胞联合表位。结论 ORFV E3L蛋白定位于细胞核和细胞质，含有多个抗原表位，可能具有免疫原性。该蛋白高度保守，具有成为优势保护性抗原的潜力。为进一步揭示ORFV E3L蛋白的功能奠定基础，为ORFV诊断方法的建立及疫苗的研制提供了理论依据。

分类号： R373

  • 相关文献

[1]SUSIRI基因的生物信息学分析及亚细胞定位. 连肖华,陈坚. 2015

[2]羊口疮病毒ORF125基因编码蛋白的结构预测及其在真核表达质粒转染细胞中的定位. 孔汉金,张克山,刘永杰,尚佑军,刘湘涛,吴斌. 2014

[3]菜豆ANK基因家族鉴定及ANK25的表达模式分析. 张婷,张双喜,裴丽丽,于太飞,陈明,李连城,周永斌,马有志,徐强. 2014

[4]甘薯等10种作物基因的生物信息学分析. 杨冬静,徐振,张成玲,孙厚俊,赵永强,谢逸萍. 2017

[5]大葱4-香豆酸辅酶A连接酶基因Af4CL的克隆及表达分析. 李逸,徐欢欢,张宇辰,王永勤,刘乐承. 2023

[6]受棉铃虫诱导的棉花糖基转移酶UGT基因家族的生物信息学及表达分析. 玛依拉·玉素音,阳妮,徐海江,杨延龙,张大伟,李春平,石必显,赖成霞. 2023

[7]林烟草KUP/HAK/KT钾转运体基因NsHAK11的亚细胞定位与表达. 宋毓峰,董连红,靳义荣,史素娟,张良. 2014

[8]茶尺蠖水通道蛋白EoAQP1的cDNA克隆、多克隆抗体制备及亚细胞定位. 李良德,王定锋,刘丰静,李慧玲,张辉,吴光远. 2016

[9]油菜(Brassica napus)β-1,4-木糖基转移酶基因BnIRX14克隆、序列分析及亚细胞定位. 董云,吴旺泽,靳丰蔚,方彦,刘婷婷,王毅,徐一涌,杨晓明. 2023

[10]长穗偃麦草EeDREB2基因的克隆与生物信息学分析. 孙珊珊,杨涛,柳珊,陈京瑞,赵昌平,唐益苗,高世庆. 2013

[11]割手密鸟氨酸转氨酶(Ssδ-OAT-2)基因的克隆与表达分析. 姚艳丽,胡小文,徐磊,邢淑莲,高玉尧,安东升,刘洋. 2018

[12]高羊茅FaGST1基因克隆、亚细胞定位及表达分析. 陈锡,赵德刚,陈莹,吴佳海,袁暘暘,王小利. 2020

[13]枇杷EjWRKY15基因克隆与蛋白特性分析. 李晓颖,徐红霞,陈俊伟. 2020

[14]中间锦鸡儿DHN1基因克隆及表达分析. 万永青,杨洋,张春林,万东莉,杨爱琴,杨杞,王瑞刚,李国婧. 2016

[15]香蕉MaGA20ox4和MaGA20ox5基因克隆、表达及亚细胞定位分析. 段雅婕,陈经烨,陈晶晶. 2021

[16]花生MAPK13基因的克隆及表达分析研究. 梁丹,张朝昕,王冕,吴正锋,陈娜,潘丽娟,王通,陈明娜,杨珍,禹山林,迟晓元. 2019

[17]荻草谷网蚜唾液蛋白基因Sm13498的克隆及功能分析. 付裕,王倩,张勇,陈巨莲. 2021

[18]小麦TaMKK2基因的克隆及功能分析. 张丹,马松梅,聂迎彬. 2024

[19]甘薯蔓割病(Fusarium oxysporum f.sp.batatas)相关基因IbMAPKK9的克隆与特性分析. 靖小菁,杨新笋,靳晓杰,刘意,雷剑,王连军,柴沙沙,张文英,焦春海. 2023

[20]花生Ah MKK4基因的克隆、表达分析和亚细胞定位研究. 王冕,张朝昕,陈娜,陈明娜,禹山林,迟晓元. 2019

作者其他论文 更多>>

微信小程序