羊口疮病毒E3L蛋白亚细胞定位及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 蒙泽菁

作者： 蒙泽菁;房永祥;贾怀杰;高真贞;陈国华;何小兵;景志忠;王晓霞

作者机构：

关键词： 羊口疮病毒;基因克隆;亚细胞定位;生物信息学

期刊名称： 中国病原生物学杂志

ISSN： 1673-5234

年卷期： 2023 年 002 期

页码： 141-146

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 目的 克隆羊口疮病毒020基因，构建其重组真核表达质粒并转染HeLa细胞，分析020基因编码E3L蛋白的亚细胞定位，分析该蛋白生物信息学特征。方法 提取羊口疮病毒基因组，PCR扩增020基因并构建重组真核表达质粒，转染HeLa细胞，采用Western blot检测其在该细胞中的表达，免疫荧光法检测该蛋白的亚细胞定位。利用DNAstar软件分析不同毒株ORFV E3L氨基酸序列特点及其遗传演化关系；利用SOMPA软件分析其二级结构；利用SignalP4.0软件预测信号肽；利用TMHMM2.0软件预测跨膜结构；利用NetPhos 3.1预测磷酸化位点；利用NetNGlyc-1.0预测糖基化位点；应用IDEB和SYFPEITHI预测ORFV E3L蛋白的抗原表位。结果 成功克隆得到ORFV 020基因，全长549 bp,编码183个氨基酸；亚细胞定位显示该蛋白定位于细胞核和细胞质。生物信息学分析ORFV E3L蛋白α螺旋约占40.44%、β折叠约占5.46%、延伸链约占16.94%、无规则卷曲约占37.16%;该蛋白无信号肽和跨膜结构，可能存在15个磷酸化位点，7个N-糖基化位点，5个B细胞线性表位，2个CTL表位，3个Th细胞表位，3个B细胞和CTL联合表位，3个B细胞和Th细胞联合表位。结论 ORFV E3L蛋白定位于细胞核和细胞质，含有多个抗原表位，可能具有免疫原性。该蛋白高度保守，具有成为优势保护性抗原的潜力。为进一步揭示ORFV E3L蛋白的功能奠定基础，为ORFV诊断方法的建立及疫苗的研制提供了理论依据。

分类号： R373

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