盐胁迫下水稻体内miRNA表达谱分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 张秀妍
作者: 张秀妍;徐妙云;郑红艳;邹俊杰;张笑宇;王磊
作者机构:
关键词: miRNA;表达谱;盐胁迫;水稻
期刊名称: 中国农业科技导报
ISSN: 1008-0864
年卷期: 2020 年 22 卷 012 期
页码: 10-19
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: miRNA是生物体内起重要调控作用的一类非编码小RNA分子,在转录后水平调控基因表达,参与生长发育、抗逆等生物学过程.高通量测序法是鉴定植物中miRNA最有效的方法之一.提取盐胁迫处理不同时间的水稻根、茎和叶部的总RNA,从中分离18~30 nt小分子RNA构建文库,进行高通量测序,对miRNA表达谱特性进行了分析.结果 表明,所有样品共检测到248个已知的miRNA,来源于132个不同的家族,根、茎、叶中分别有31、11、9个差异表达miRNA,分属于29个家族,靶向592个功能基因,并对其中5个差异显著且与非生物胁迫相关的重要miRNA进行了qPCR分析检测,结果显示Osa-miR166h、Osa-miR166k上调表达,Osa-miR169h、Osa-miR530下调表达,针对Osa-miR169h的4个靶基因进一步定量检测,其中的3个靶基因上调表达,这与Osa-miR169h的下调表达结果相一致,以上结果说明miRNA在植物抵御非生物逆境胁迫的过程中扮演重要角色.
分类号: Q78
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