中华虎头蟹线粒体16S rRNA和COⅠ基因的序列比较及其系统进化分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 刘萍
作者: 刘萍;段亚飞;毛智超;李吉涛;高保全;李健
作者机构:
关键词: 中华虎头蟹;线粒体DNA;16S rRNA基因;COⅠ基因;序列分析
期刊名称: 水产学报
ISSN: 1000-0615
年卷期: 2013 年 37 卷 10 期
页码: 1441-1451
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为研究中华虎头蟹野生群体的种质资源及遗传多样性状况,采用PCR扩增获得中华虎头蟹线粒体DNA的16S rRNA和COⅠ基因片段,分别对其进行序列比较及系统进化分析。16S rRNA和COⅠ基因片段的A+T平均含量分别为67.7%和61.4%,A+T含量显著高于G+C含量。长度为515 bp的16S rRNA基因片段共检测出单倍型4种,多态性位点4个,均为单一变异位点;长度为653 bp的COⅠ基因片段共检测出单倍型11种,多态性位点23个,其中简约信息位点5个和单一变异位点18个。COⅠ基因片段比16S rRNA基因片段具有较大的变异,更适于中华虎头蟹种群的遗传多样性分析。基于16S rRNA和COⅠ基因片段的遗传距离与系统进化分析结果一致,表明中华虎头蟹与梭子蟹科的蟹类亲缘关系最近,方蟹科与沙蟹科的蟹类聚为一支,与传统分类结果基本一致;而脊椎动物2个基因片段的系统进化分析结果不一致。根据16S rRNA基因片段的遗传距离推测出4科7种蟹的大致分化时间发生在古新世至始新世。
分类号: S917.4
- 相关文献
[1]哈氏仿对虾线粒体16S rRNA和COⅠ基因的序列比较及其与仿对虾属之间的系统进化分析. 毛智超,段亚飞,刘萍,李健,陈萍. 2016
[2]利用PCR技术鉴别畜禽肉中鸭源性成分研究. 张晶鑫,高玉时,樊艳凤,唐修君,贾晓旭,顾荣,陆俊贤. 2015
[3]两种蛤仔线粒体16S rRNA基因和COⅠ基因的序列比较. 刘相全,包振民,方建光,王如才. 2011
[4]银鲳3个野生群体线粒体COⅠ基因的序列差异分析. 彭士明,施兆鸿,侯俊利,张浩,赵峰. 2009
[5]基于线粒体DNACOⅠ基因鉴别畜禽肉中鸡源性成分. 唐修君,樊艳凤,葛庆联,贾晓旭,张静,刘茵茵,张小燕,王珏,高玉时. 2017
[6]基于线粒体COⅠ基因的畜禽肉中鸭源性成分鉴别方法研究. 盛中伟,唐修君,樊艳凤,贾晓旭,陆俊贤,高玉时. 2020
[7]入侵害虫西花蓟马及其他8种常见蓟马的分子鉴定. 游中华,路虹,张宪省,冯纪年,石宝才,宫亚军,黄大卫. 2007
[8]钦州湾牡蛎线粒体16 S rRNA基因片段核苷酸序列分析. 蒋伟明,陈秀荔,赵永贞,陈晓汉,江世贵,李咏梅. 2008
[9]荧光PCR法检测畜禽肉中的鸡源性成分. 唐修君,樊艳凤,贾晓旭,葛庆联,唐梦君,张小燕,陈大伟,高玉时. 2018
[10]苹果蠹蛾线粒体DNA COⅠ基因克隆与序列分析. 冯宏祖,王兰,郭文超,曹玉,杨明禄,刘慧敏,许建军. 2012
[11]4种鳕鱼线粒体16S rRNA、COI和Cyt b基因片段序列的比较研究. 毕潇潇,高天翔,肖永双,李永振. 2009
[12]家蚕线粒体基因组EcoRⅠ2.0kb片段的克隆及序列分析. 沈兴家,赵巧玲,张志芳,李奕仁,何家禄. 2000
[13]两种鲷属鱼类线粒体COI基因片段序列的比较. 张凤英,马凌波,施兆鸿,夏连军,马春艳. 2006
[14]线粒体nad5基因在隐藏管状线虫及四翼无刺线虫的序列变异研究. 杨言川,李作磊,张念章,刘光学,朱兴全,孙晓林. 2014
[15]水稻线粒体DNA雄性不育有关特异片段的克隆及序列分析. 许仁林,谢东师,素云,陆维忠,国伟,汪训明. 1995
[16]鹿科动物线粒体DNA序列差异和系统进化关系分析. 鞠妍,刘华淼,邢秀梅. 2016
[17]家蚕蛹线粒体DNA EcoRⅠ 1.9kb片段的克隆及序列分析. 沈兴家,赵巧玲,张志芳,李奕仁,何家禄. 2000
[18]两种鼠蛲虫线粒体cytb基因的种间及种内序列变异研究. 杨言川,鲁力,田伟鹏,刘光学,朱兴全,孙晓林. 2014
[19]黄鲷线粒体COⅠ基因部分序列遗传变异研究. 张凤英,夏连军,马凌波,施兆鸿,马春艳. 2005
[20]印度华首线虫核糖体和线粒体基因序列多态性分析. 周成艳,马君,刘伟,徐前明,朱兴全. 2019
作者其他论文 更多>>
-
植物生长调节剂对间作大豆生长发育及抗倒伏的影响
作者:刘萍;毕海滨;杨云峰;卓玛;赵晴晴;文廷刚;陈昱利
关键词:夏大豆;植物生长调节剂;硅肥;胺鲜·甲哌鎓;生长发育;抗倒性;大豆玉米带状复合种植
-
遮阴处理对玉米子粒败育及产量的影响
作者:常晓;王小博;刘柏林;杨兆生;李健
关键词:玉米(Zea mays L.);遮阴;子粒败育;产量
-
川西高原糯性青稞新品种-康青糯2号
作者:詹瑞玲;谢世刚;李健;江谧;张英;杨开俊;涂洋;朱华忠;刘军;吴定强;刘廷辉
关键词:
-
河南省冬小麦田杂草群落分布现状及其变化原因分析
作者:高兴祥;孔媛;张耀中;李美;李健;金岩;张国福;刘帅帅;刘明平;曾艳;柏连阳
关键词:河南省;杂草群落;冬小麦田;群落演替
-
1株牛源产气克雷伯菌的分离鉴定及药物敏感性分析
作者:蔡江;刘志杰;聂帅帅;李鹏飞;杜国玉;吴锦艳;曹小安;尚佑军;李有文;刘萍
关键词:牛呼吸疾病综合征;产气克雷伯菌;细菌分离;致病性;耐药性
-
太子参皂苷对卵清白蛋白免疫小鼠肠道应答的影响
作者:陈颖清;曾丽;赵佳梅;杜蓥蓥;曾靖棋;周梦圆;秦凤远;江珊;李健;潘慧青;马玉芳
关键词:太子参皂苷;卵清白蛋白;佐剂;肠道免疫应答
-
小麦鸟害的发生及防治措施
作者:张云峰;杨彪;李嘉杰;李健;高月蔚;夏先全
关键词:鸟害;病虫草害防治;试验品种;洪雅县;防治方法;水肥管理;预防措施;预防和控制