中华虎头蟹线粒体16S rRNA和COⅠ基因的序列比较及其系统进化分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 刘萍

作者: 刘萍;段亚飞;毛智超;李吉涛;高保全;李健

作者机构:

关键词: 中华虎头蟹;线粒体DNA;16S rRNA基因;COⅠ基因;序列分析

期刊名称: 水产学报

ISSN: 1000-0615

年卷期: 2013 年 37 卷 10 期

页码: 1441-1451

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为研究中华虎头蟹野生群体的种质资源及遗传多样性状况,采用PCR扩增获得中华虎头蟹线粒体DNA的16S rRNA和COⅠ基因片段,分别对其进行序列比较及系统进化分析。16S rRNA和COⅠ基因片段的A+T平均含量分别为67.7%和61.4%,A+T含量显著高于G+C含量。长度为515 bp的16S rRNA基因片段共检测出单倍型4种,多态性位点4个,均为单一变异位点;长度为653 bp的COⅠ基因片段共检测出单倍型11种,多态性位点23个,其中简约信息位点5个和单一变异位点18个。COⅠ基因片段比16S rRNA基因片段具有较大的变异,更适于中华虎头蟹种群的遗传多样性分析。基于16S rRNA和COⅠ基因片段的遗传距离与系统进化分析结果一致,表明中华虎头蟹与梭子蟹科的蟹类亲缘关系最近,方蟹科与沙蟹科的蟹类聚为一支,与传统分类结果基本一致;而脊椎动物2个基因片段的系统进化分析结果不一致。根据16S rRNA基因片段的遗传距离推测出4科7种蟹的大致分化时间发生在古新世至始新世。

分类号: S917.4

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