菠菜NBS-LRR类抗病基因同源序列的克隆及分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 折红兵

作者： 折红兵;范桂彦;张合龙;王晓武;武剑;钱伟;徐兆生

作者机构：

关键词： 菠菜;抗病基因同源序列;NBS-LRR;菠菜霜霉病

期刊名称： 中国蔬菜

ISSN： 1000-6346

年卷期： 2017 年 1 卷 05 期

页码： 26-33

收录情况： 北大核心

摘要： 依据已知NBS-LRR类抗病基因的P-loop和GLPL两个保守结构域设计简并引物,对抗菠菜霜霉病商业杂交种RZ51-147、自交系12S3和12S4的基因组DNA进行PCR扩增、克隆和序列测定,共获得23条具有完整开放阅读框且含有NBS结构的抗病基因同源序列(resistancegeneanalogs,RGAs),编号为SP1~SP17、SP19~SP24,其在NCBI中的登录号为KX914865~KX914887。核苷酸比较分析结果表明,这23条RGAs大多与甜菜中推测的一些抗病蛋白基因或其他相关蛋白基因具有较高的同源性,其中SP1、SP2、SP5、SP6、SP10、SP11、SP12、SP13等8条序列均与甜菜RF45类抗病蛋白有着86%以上的同源性;SP3、SP4、SP8、SP9、SP24等5条序列与甜菜RPP13类抗病蛋白的同源性在85%以上,与向日葵抗霜霉病基因PI8相应区域的氨基酸序列相似性为32.20%~33.52%,且在进化树上聚为一类,推测其可能与抗霜霉病相关。同源进化分析结果表明,除SP7外,其余序列均为non-TIR-NBS-LRR类抗病基因,并与推导的氨基酸序列多重比较结果一致。

分类号： S436.36

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