H1N1亚型猪流感病毒广东分离株全基因克隆及其遗传演化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘大飞

作者： 刘大飞;刘明;刘春国;杨涛;刘大程

作者机构：

关键词： 猪流感病毒;RT-PCR;克隆;遗传演化分析

期刊名称： 病毒学报

ISSN： 1000-8721

年卷期： 2008 年 24 卷 05 期

页码： 358-363

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了研究H1N1亚型SIV遗传演化与变异的特性,采用RT-PCR技术分别扩增A/Swine/Guangdong/LM/2004(H1N1)的8个基因片段,分别将其克隆到pMD18-T载体,进行全基因组序列测定。核苷酸序列测定结果显示:LM株SIV各基因片段均未发现核苷酸插入或缺失现象。HA切割位点处的氨基酸序列序列为IPSIQSR↓G,与高致病性SIV的H1N1亚型毒株的分子特征不符合。HA基因含有6个潜在的N-糖基化位点,4个在HA1的第11、23、87、和276位,增加2个分别在HA2的154和213位点;NA基因不仅在58、63、68、88和146位含有高度保守的N-糖基化位点,而且在44和235位增加2个潜在的N-糖基化位点,这可能是近期H1N1亚型SIV的一个分子特征。核苷酸同源性结果:HA基因与类人谱系的流感病毒分离株有很高的同源性(99%),而其他基因均与古典猪谱系的流感病毒分离株同源性较高(87%～98%)。从绘制的各个片段进化树和核苷酸同源性分析结果,可以推测该毒株HA基因可能来源于类人谱系的流感病毒;而其他基因来源于古典猪谱系的流感病毒。

分类号： S852.659.5

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