大麦BAC文库三维混合池的构建与HvGW2筛选

文献类型： 中文期刊

第一作者： 郭刚刚

作者： 郭刚刚;董国清;周进;达瓦顿珠;袁兴淼;张京

作者机构：

关键词： 大麦;BAC文库;三维混合池;HvGW2;粒重基因

期刊名称： 中国农业科学

ISSN： 0578-1752

年卷期： 2013 年 46 卷 01 期

页码： 9-17

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】从大麦BAC文库中快速筛选包含目的基因HvGW2的阳性BAC克隆。【方法】构建BAC文库三维混合池,设计2对HvGW2特异性引物,进行BAC文库筛选,对含有目的基因HvGW2的阳性BAC克隆进行测序,获得编码大麦GW2蛋白的基因组DNA序列,并与禾本科中的GW2进行同源进化分析。【结果】构建了大麦BAC文库的三维混合池160个,文库空载率为0.18%;筛选到含HvGW2的阳性BAC克隆3个,其中,BAC克隆196M02包含完整编码该基因的序列;HvGW2包含8个外显子和7个内含子,具有与其它植物GW2相似的结构特征和保守的功能结构域;同源进化分析结果显示,大麦与小麦的GW2蛋白同源性最高;序列分析发现,HvGW2第6内含子上包含2个不同类型的反转录转座子插入,从而使大麦比其它作物的GW2长度增加11.5 kb以上。【结论】通过构建三维混合池快速筛选包含目的基因的单个阳性BAC克隆,建立了大麦目标基因克隆的辅助平台;HvGW2基因组中位于内含子区的反转录转座子插入导致基因长度增加,可能是影响该基因转录水平的关键变异。

分类号： S512.3

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