稻粒黑粉病菌实时荧光定量PCR内参基因筛选

文献类型： 中文期刊

第一作者： 盘林秀

作者： 盘林秀;王娜;王爱军;夏园;付成林;殷得所;郑爱萍

作者机构： 四川农业大学水稻研究所;四川农业大学西南作物基因资源与遗传改良教育部重点试验室;湖北省农业科学院粮食作物研究所

关键词： 稻粒黑粉病菌;实时荧光定量PCR;内参基因

期刊名称： 植物病理学报

ISSN： 0412-0914

年卷期： 2018 年 05 期

页码： 640-647

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 实时荧光定量PCR是一种被广泛应用于基因表达研究的分子技术,内参基因的选择对试验结果的可靠性起重要作用。稻粒黑粉病是一种全球性水稻真菌病害,目前没有关于稻粒黑粉病菌内参基因的报道。本文选择6个常用内参基因,对其在稻粒黑粉病菌不同菌株、不同生活史阶段和不同浓度Basta处理3组生物学样本中的稳定性进行比较分析。经geNorm3.5、NormFinder0.953及BestKeeper1.0软件综合评价,结果显示在不同菌株、不同生活史阶段、不同浓度Basta处理生物学样本中,最稳定的内参基因分别为UBQ、GAPDH和EF1α,最优组合分别为UBQ/GAPDH、UBQ/GAPDH和EF1α/GAPDH。本研究结果为稻粒黑粉病菌基因表达研究奠定了基础,同时对其他真菌内参基因的选择提供了参考。

分类号： S435.111.4

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