赤霉素负调控因子GhRGL(RGL-LIKE)基因序列与功能预测分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 廖文彬

作者： 廖文彬;崔百明;温玮;彭明

作者机构：

关键词： 海岛棉;GhRGL基因;DELLA蛋白;序列分析;功能预测

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2009 年 30 卷 02 期

页码： 53-58

收录情况： CSCD

摘要： 海岛棉(Gossypium barbadenseL.)的产量与激素相关,根据基因序列的同源性,笔者首次从海岛棉中克隆到1个类似赤霉素(GA)信号途径中的负调控因子DELLA蛋白基因,并对该基因的序列进行分析。结果表明:该基因序列包含有DELLA蛋白所有的保守结构域,如DELLA结构域、VHYNP结构域、多聚PolyS/T保守区、2个亮氨酸拉链、1个GRAS结构域、1个核定位信号和1个VHVID保守区;其蛋白序列与拟南芥中的5个DELLA蛋白GAInsensitive(GAI)、Repressorofga1-3(RGA)、RGL1(RGA-like1)、RGL2、RGL3氨基酸序列的相似度分别为60.5%、59.8%、63.1%、61.8%和58.1%。特将其定义为GhRGL。对GhRGL基因的5′序列进行克隆并利用Plantcare进行元件预测,发现该基因启动子存在着大量与激素相关的调控元件,暗示该基因的功能可能与激素调控有关。利用ProtScale程序对该蛋白进行疏/亲水性分析,初步确定该蛋白质的抗原决定簇的位置,为该基因的抗体制备奠定了基础。

分类号： S562

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