利用oligo芯片技术鉴定橡胶树死皮相关基因
文献类型: 中文期刊
第一作者: 覃碧
作者: 覃碧;刘向红;邓治;李德军
作者机构:
关键词: 橡胶树;死皮;oligo芯片;TPD相关基因;RT-PCR
期刊名称: 热带作物学报
ISSN: 1000-2561
年卷期: 2012 年 33 卷 02 期
页码: 101-106
收录情况: CSCD
摘要: 橡胶树死皮(Tapping Panel Dryness,TPD)是天然橡胶单产提高的主要限制因子之一,给橡胶种植业带来严重危害。本研究利用定制橡胶树oligo芯片,通过提取死皮和健康橡胶树胶乳总RNA,标记并反转录成cDNA后与橡胶树oligo芯片进行杂交鉴定TPD相关基因,利用RT-PCR技术对芯片结果进行验证。对芯片数据分析结果显示,以2倍标准在死皮与健康橡胶树间筛选到26个差异表达基因,其功能涉及橡胶生物合成、细胞程序性死亡、细胞抗性及防御反应、活性氧代谢、DNA甲基化、泛素-蛋白酶体、信号传导、蛋白质合成、加工及转运等调控途径。进一步的RT-PCR验证结果表明,随机选取12个基因的表达模式均与芯片结果一致。本研究为大规模鉴定TPD相关基因和揭示TPD发生分子机制奠定了基础。
分类号: S794.1
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