细粒棘球蚴RTN4基因的克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘田莉

作者： 刘田莉;孟庆玲;乔军;陈诚;马玉;胡政香;才学鹏;陈创夫

作者机构：

关键词： 细粒棘球蚴;抗原基因;基因克隆;生物信息学分析

期刊名称： 西北农林科技大学学报(自然科学版)

ISSN： 1671-9387

年卷期： 2016 年 44 卷 03 期

页码： 17-22

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】克隆细粒棘球蚴(Eg)内质网膜蛋白4(Reticulon-4,RTN4)抗原基因,对其序列进行生物信息学分析。【方法】采集感染Eg的绵羊肝脏和肺脏,提取Eg头节总RNA为模板,对RTN4基因进行RT-PCR扩增,将PCR产物克隆到pMD19-T载体后测序,对其核苷酸序列及氨基酸序列进行生物信息学分析。【结果】Eg RTN4cDNA全长654bp,编码217个氨基酸,蛋白质分子质量为25.3ku,等电点为8.83。编码氨基酸序列中含有1个N端酰基化位点、2个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点和4个蛋白激酶C磷酸化位点。经生物信息学软件预测,RTN4蛋白的抗原表位区主要集中在第1-47位、第71-147位和第171-217位区域;含有2个高度疏水区,2个跨膜区,膜外区分别位于第1-47位和第171-217位。【结论】成功克隆了Eg RTN4基因,预测了其编码蛋白抗原的结构和表位。

分类号： S852.734

  • 相关文献

[1]细粒棘球蚴TSP1和TSP6基因的克隆及生物信息学分析. 刘田莉,孟庆玲,乔军,陈诚,马玉,胡政香,才学鹏,陈创夫. 2015

[2]日本血吸虫多价核酸疫苗的构建及免疫保护实验. 翟羽佳,刘全,高胜岩,姜丽,门静涛,商立民,魏峰,林矫矫,傅志强,朱兴全. 2009

[3]花生谷氨酸脱氢酶基因AhGDH1的克隆与生物信息学分析. 陈湘瑜,徐日荣,林栩松,唐兆秀. 2016

[4]灰毡毛忍冬MADS-box基因家族AGL15基因的克隆、生物信息学和表达分析. 蔡嘉洛,朱贻霖,陈林,樊悦,刘峰,张亚丽,欧阳琳,刘湘丹. 2016

[5]栽培种花生FAE1基因的克隆和序列分析. 张欣,孙全喜,吴琪,王秀贞,胡东青,唐月异,王志伟,宋国生,徐建志,殷冬梅,王传堂. 2018

[6]小偃麦异附加系TaXTH基因的克隆与生物信息学分析. 黄春丽,宋静,李全权,郭庆东,田秋菊,高居荣,王洪刚,封德顺. 2015

[7]小麦ent-柯巴基焦磷酸合酶基因TaCPS1的克隆与荧光定量分析. 郭庆东,李全权,田秋菊,钱艳丽,许田,杨艳林,王洪刚,封德顺. 2016

[8]菊花抗白色锈病相关基因CmDREBa-2的克隆及表达分析. 熊超明,赵兴华,贾红梅,延昕,毛洪玉. 2018

[9]杜仲BR受体蛋白基因EuBRI1克隆及生物信息学分析. 刘明月,赵懿琛,赵德刚. 2018

[10]芝麻抗裂蒴基因SiIND1的克隆与原核表达. 刘艳阳,武轲,梅鸿献,杜振伟,崔承齐,江晓林,郑永战. 2020

[11]苹果蠹蛾8个烟碱型乙酰胆碱受体基因的克隆与生物信息学分析. 罗嘉鹏,冯丽凯,李飞,林克剑,王桂荣. 2018

[12]菜用大豆蔗糖转运蛋白基因Glyma18g15950的克隆及生物信息学分析. 张玉梅,胡润芳,林国强. 2019

[13]野葛钙离子依赖性核酸酶PlCaN基因克隆和生物信息学分析. 郭坤元,林先明,何美军,郭汉玖. 2018

[14]玉米蔗糖转运蛋白基因ZmSUT3J的克隆及生物信息学分析. 李楠,朱旭,柳青,郭嘉,孙传波,李传龙,贺红利,贺红霞. 2021

[15]魔芋软腐病pelD和pelE基因的克隆与表达分析. 陈恩发,刘辉,丁海兵,潘牧,王启富. 2021

[16]菠菜SpNHX1基因的克隆及生物信息学分析. 张海洋,付娆,李茹霞,顾寅钰,梁晓艳,宋延静,李萌,王向誉,郭洪恩. 2019

[17]高粱转录因子基因SbSBP15的克隆及表达分析. 方远鹏,蒋君梅,杜巧丽,陈美晴,裴会敏,屈志广,任明见,谢鑫. 2020

[18]牦牛RETN基因克隆及组织表达分析. 侯孟典,王会,柴志欣,王吉坤,信金伟,姬秋梅,钟金城. 2019

[19]杜仲EuDREB1基因的克隆及生物信息学分析. 杨玲玲,王磊,赵德刚,赵懿琛. 2018

[20]高羊茅FaGST1基因克隆、亚细胞定位及表达分析. 陈锡,赵德刚,陈莹,吴佳海,袁暘暘,王小利. 2020

作者其他论文 更多>>

微信小程序