菊芋WRKY转录因子家族基因的鉴定及分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赵孟良

作者： 赵孟良;郭怡婷;任延靖

作者机构： 青海大学农林科学院青海省蔬菜遗传与生理重点实验室

关键词： 菊芋;WRKY;转录因子;鉴定分析

期刊名称： 生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2023 年 39 卷 002 期

页码： 116-125

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 菊芋属抗旱性物种,通过对菊芋转录组数据进行分析,筛选与菊芋响应干旱胁迫密切相关的WRKY转录因子基因,为明晰菊芋WRKY家族基因的功能奠定理论基础.采用生物信息学方法,对菊芋WRKY基因家族成员的理化性质、保守结构域、蛋白质三级结构及其与其他物种的系统进化关系进行分析,利用RT-qPCR方法检测干旱胁迫下,菊芋WRKY基因在种子、根、茎、 叶、花瓣及块茎的相对表达量,以及菊芋WRKY基因家族成员的转录水平.结果表明,在菊芋叶片中共鉴定出74个WRKY基因,序列长度为510-2040 bp,检测到的motif基序的长度为25-50个碱基,系统进化树分析显示,大部分HtWRKY基因能够与其他WRKY基因聚为一类;组织特异性表达分析结果显示,HtWRKY基因在花瓣和块茎的相对表达量较高,干旱诱导表达分析显示,分别有20个和19个HtWRKY基因在菊芋叶片和根中呈现出诱导后上升表达的趋势.HtWRKY参与了菊芋抵御干旱胁迫的过程.

分类号： S632.9

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