适用于玉米DNA指纹库构建的SSR核心引物的重新设计与优化

文献类型： 中文期刊

第一作者： 于新艳

作者： 于新艳;王凤格;赵久然;王玺;易红梅;王璐;郭景伦;匡猛;孙艳美

作者机构：

关键词： 玉米;SSR;核心引物;引物设计

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2007 年 5 卷 03 期

页码： 151-155

收录情况： CSCD

摘要： 为了确定出适用于玉米DNA指纹库构建的引物,对部分并不是完全符合玉米DNA指纹库构建引物筛选原则的引物进行重新设计与优化,使其基本符合核心引物设计的要求。以umc2105、umc1705和phi299852为例,下载原引物的基因组序列,利用两个常用的引物设计软件Primer Premier5.0和Oligo6.57进行引物的重新设计及评估,在Tm值、GC含量、引发效率、错误引发率、3'端G值、引物二聚体等方面对引物进行改善,结果表明,经过对原引物的重新设计和优化,新设计的引物均能清晰的扩增,扩增效果得到了明显的改善,并且均能在统一的条件下进行实验,符合了玉米DNA指纹库构建的要求。

分类号： S513

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