巴西橡胶树6个小G蛋白基因cDNA的克隆与序列分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 石峰
作者: 石峰;秦云霞;唐朝荣
作者机构:
关键词: 巴西橡胶树;小G蛋白;全长cDNA;进化树;胶乳
期刊名称: 热带作物学报
ISSN: 1000-2561
年卷期: 2009 年 30 卷 03 期
页码: 320-326
收录情况: CSCD
摘要: 利用笔者实验室建立的橡胶树胶乳EST序列数据库,结合RT-PCR和RACE技术,克隆巴西橡胶树6个小G蛋白基因的cDNA,并以拟南芥小G蛋白家族基因为模板进行进化树分析。结果表明:所克隆的基因分属于小G蛋白的Arf与Rab家族,将其分别命名为HbArf1、HbArf2、HbRab1、HbRab2、HbRab3和HbRab4。氨基酸序列分析发现,HbRab1、HbRab2、HbRab3和HbRab4均具有小G蛋白家族的保守结构域,即4个鸟苷酸(GTP/GDP)结合域、1个效应区和C端半胱氨酸结构域,而HbArf1和HbArf2除在C端无半胱氨酸结构域及效应区序列保守性差外,HbArf1还缺少2个鸟苷酸结合区,HbArf2缺少1个鸟苷酸结合区。
分类号: S794.1
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