巴西橡胶树HbRD22基因的电子克隆与生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 高静中国热带农业科学院科技信息研究所

作者: 高静中国热带农业科学院科技信息研究所;程汉;蔡海滨;安泽伟;黄华孙

作者机构:

关键词: 巴西橡胶树;HbRD22基因;电子克隆;生物信息学

期刊名称: 热带作物学报

ISSN: 1000-2561

年卷期: 2010 年 31 卷 09 期

页码: 1439-1445

收录情况: CSCD

摘要: 利用电子克隆技术从低温诱导的巴西橡胶树全长cDNA文库中获得了HbRD22基因,该基因全长1 458 bp。生物信息学分析结果表明,HbRD22编码一个由338个氨基酸组成的、相对分子量为36.96 ku、等电点为7.65的多肽,并含有一个由217个氨基酸组成的BURP结构域。其推导的氨基酸序列与葡萄的同源性最高,达69%。信号肽预测结果表明HbRD22蛋白为分泌型蛋白,前21个氨基酸区域为信号肽区域。Northern blotting分析结果表明,该基因在正常生长情况下,表达水平较高,干旱胁迫后24 h,表达量逐渐减低,直至检测不到,揭示该基因受干旱胁迫负调控。

分类号: S794.1

  • 相关文献

[1]猪SRPK1基因的电子克隆. 俄广鑫,刘娣,谢雨彤,祝继原,杨少成,王嘉博,赵金凤. 2010

[2]绵羊LDHAL6A基因的电子克隆与生物信息学预测. 闫秋良,翟洪军,马惠海,金海国,李双双,曹阳,武斌,赵玉民. 2013

[3]澳洲坚果bHLH基因家族成员MibHLH48的结构与功能分析. 王文林,陈海生,张涛,郑树芳,樊松乐,王萌,谭秋锦,韦媛荣,黄锡云. 2021

[4]甜樱桃PaGAST基因的电子克隆及生物信息学分析. 李菊,谢红江,杨文渊,陶炼,李洪雯. 2018

[5]小麦相关功能基因的全基因组电子定位及基因注释. 王长彪,韩斌,刘江,崔婷,任永康,赵兴华,董艳辉,李亚丽,唐朝晖. 2016

[6]香蕉MYB转录因子基因的电子克隆及生物信息学分析. 谭琳,康由发,郑晓燕,黄丽娜,陈娇,马蔚红. 2015

[7]猪CAPN2基因的生物信息学分析. 王学敏,李碧侠,任守文. 2008

[8]生物信息学在发现新基因方面的应用. 冯浩咏,苗向阳,罗绪刚,胡婕. 2007

[9]大麦MBF1基因的电子克隆与生物信息学分析. 秦丹丹,许甫超,董静,葛双桃,李梅芳. 2014

[10]牛PSME1基因的电子克隆与序列分析. 曹随忠,李宏滨,姚学萍,赵兴绪,杜立新. 2007

[11]奶牛乳房炎抗性相关基因Znf313的电子克隆与序列分析. 曹随忠,李宏滨,姚学萍,赵兴绪,杜立新. 2006

[12]陆地棉GhNIP5.1基因的电子克隆及生物信息学分析. 巩元勇,郭书巧,束红梅,何林池,倪万潮. 2013

[13]一个新的玉米WRKY基因识别及其生物信息学分析. 胡守景,张治礼. 2008

[14]葡萄中一类AP2/EREBP-B1亚族转录因子的电子克隆及生物信息学分析. 郑建立,高峰,田永生,高建杰,帅建军,彭日荷,熊爱生,姚泉洪. 2011

[15]森林草莓精氨酸脱羧酶基因的电子克隆与序列分析. 王静,赵密珍,王壮伟,吴伟民,钱亚明. 2011

[16]向日葵抗坏血酸过氧化物酶的电子克隆和生物信息学分析. 孟鹏,李根英,陈国强,王振东. 2012

[17]长穗偃麦草ThPLA基因的电子克隆和生物信息学分析. 张宴萍,黄德华,李鹏,崔正勇,何方,闫百蔷. 2024

[18]木薯MADS-box基因克隆及其响应乙烯信号的表达模式分析. 廖文彬,王淦,彭明. 2013

[19]割手密谷胱甘肽硫转移酶基因SsGST的克隆与生物信息学分析. 徐磊,胡小文,姚艳丽,邢淑莲,刘洋. 2015

[20]牛PS ME1基因的电子克隆与序列分析. 曹随忠,李宏滨,姚学萍,赵兴绪,杜立新. 2007

作者其他论文 更多>>