巴西橡胶树HbRD22基因的电子克隆与生物信息学分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 高静中国热带农业科学院科技信息研究所
作者: 高静中国热带农业科学院科技信息研究所;程汉;蔡海滨;安泽伟;黄华孙
作者机构:
关键词: 巴西橡胶树;HbRD22基因;电子克隆;生物信息学
期刊名称: 热带作物学报
ISSN: 1000-2561
年卷期: 2010 年 31 卷 09 期
页码: 1439-1445
收录情况: CSCD
摘要: 利用电子克隆技术从低温诱导的巴西橡胶树全长cDNA文库中获得了HbRD22基因,该基因全长1 458 bp。生物信息学分析结果表明,HbRD22编码一个由338个氨基酸组成的、相对分子量为36.96 ku、等电点为7.65的多肽,并含有一个由217个氨基酸组成的BURP结构域。其推导的氨基酸序列与葡萄的同源性最高,达69%。信号肽预测结果表明HbRD22蛋白为分泌型蛋白,前21个氨基酸区域为信号肽区域。Northern blotting分析结果表明,该基因在正常生长情况下,表达水平较高,干旱胁迫后24 h,表达量逐渐减低,直至检测不到,揭示该基因受干旱胁迫负调控。
分类号: S794.1
- 相关文献
[1]猪SRPK1基因的电子克隆. 俄广鑫,刘娣,谢雨彤,祝继原,杨少成,王嘉博,赵金凤. 2010
[2]绵羊LDHAL6A基因的电子克隆与生物信息学预测. 闫秋良,翟洪军,马惠海,金海国,李双双,曹阳,武斌,赵玉民. 2013
[3]澳洲坚果bHLH基因家族成员MibHLH48的结构与功能分析. 王文林,陈海生,张涛,郑树芳,樊松乐,王萌,谭秋锦,韦媛荣,黄锡云. 2021
[4]甜樱桃PaGAST基因的电子克隆及生物信息学分析. 李菊,谢红江,杨文渊,陶炼,李洪雯. 2018
[5]小麦相关功能基因的全基因组电子定位及基因注释. 王长彪,韩斌,刘江,崔婷,任永康,赵兴华,董艳辉,李亚丽,唐朝晖. 2016
[6]香蕉MYB转录因子基因的电子克隆及生物信息学分析. 谭琳,康由发,郑晓燕,黄丽娜,陈娇,马蔚红. 2015
[7]猪CAPN2基因的生物信息学分析. 王学敏,李碧侠,任守文. 2008
[8]生物信息学在发现新基因方面的应用. 冯浩咏,苗向阳,罗绪刚,胡婕. 2007
[9]大麦MBF1基因的电子克隆与生物信息学分析. 秦丹丹,许甫超,董静,葛双桃,李梅芳. 2014
[10]牛PSME1基因的电子克隆与序列分析. 曹随忠,李宏滨,姚学萍,赵兴绪,杜立新. 2007
[11]奶牛乳房炎抗性相关基因Znf313的电子克隆与序列分析. 曹随忠,李宏滨,姚学萍,赵兴绪,杜立新. 2006
[12]陆地棉GhNIP5.1基因的电子克隆及生物信息学分析. 巩元勇,郭书巧,束红梅,何林池,倪万潮. 2013
[13]一个新的玉米WRKY基因识别及其生物信息学分析. 胡守景,张治礼. 2008
[14]葡萄中一类AP2/EREBP-B1亚族转录因子的电子克隆及生物信息学分析. 郑建立,高峰,田永生,高建杰,帅建军,彭日荷,熊爱生,姚泉洪. 2011
[15]森林草莓精氨酸脱羧酶基因的电子克隆与序列分析. 王静,赵密珍,王壮伟,吴伟民,钱亚明. 2011
[16]向日葵抗坏血酸过氧化物酶的电子克隆和生物信息学分析. 孟鹏,李根英,陈国强,王振东. 2012
[17]长穗偃麦草ThPLA基因的电子克隆和生物信息学分析. 张宴萍,黄德华,李鹏,崔正勇,何方,闫百蔷. 2024
[18]木薯MADS-box基因克隆及其响应乙烯信号的表达模式分析. 廖文彬,王淦,彭明. 2013
[19]割手密谷胱甘肽硫转移酶基因SsGST的克隆与生物信息学分析. 徐磊,胡小文,姚艳丽,邢淑莲,刘洋. 2015
[20]牛PS ME1基因的电子克隆与序列分析. 曹随忠,李宏滨,姚学萍,赵兴绪,杜立新. 2007
作者其他论文 更多>>
-
耐寒抗风高产橡胶树品种培育及其应用
作者:黄华孙;李维国;和丽岗;李国华;李智全;林位夫;高新生;谢黎黎;曾霞;黄飞
关键词:
-
橡胶树体胚苗质量调查与分析
作者:彭素娜;徐正伟;华玉伟;顾晓川;成镜;黄华孙;黄天带
关键词:橡胶树;体胚苗;质量指标;种苗质量
-
遮光对五指毛桃植株生物量分配及营养成分组成特征的影响
作者:袁淑娜;潘剑;黄坚雄;桂青;郑定华;蔡海滨;王秀全
关键词:五指毛桃;遮阴;生物量分配;营养成分
-
橡胶灵芝菌内参基因筛选与分析
作者:赵欣阳;罗佑红;蔡海滨;周燚;涂敏
关键词:橡胶树;红根病;橡胶灵芝菌;内参基因;实时荧光定量PCR
-
橡胶树改变世界的150年
作者:高静;程汉
关键词:
-
树木伯克霍尔德氏菌DHR18诱导橡胶树抗病性相关防御酶分析
作者:罗佑红;赵欣阳;蔡海滨;孟祥佳;周燚;涂敏
关键词:伯克霍尔德氏菌;橡胶树;胶孢炭疽菌;诱导抗病性;防御酶
-
巴西橡胶树GRAS基因家族鉴定及表达分析
作者:李娟;袁渊;吴挺开;邓治;程汉
关键词:巴西橡胶树;GRAS基因家族;生物信息学;基因表达;DELLA