柑橘鳞皮病毒3个分离物全基因组序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李敏

作者： 李敏;周天宇;张松;杨方云;周彦;周常勇;李中安;曹孟籍

作者机构：

关键词： 柑橘;柑橘鳞皮病毒;全基因组;系统发育分析

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2018 年 10 期

页码： 2030-2036

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 运用转录组测序和RT-PCR方法克隆测定了柑橘鳞皮病毒(Citruspsorosisvirus,CPsV)3个分离物CHN-1、CHN-2和CHN-3的全基因组。序列分析结果表明,CHN-1、CHN-2和CHN-3的基因组全长分别为11 282、11 279和11 278 nt,均包含4个开放阅读框。CHN-1、CHN-2和CHN-3之间的核苷酸相似性为93.48%～95.98%,编码氨基酸相似性为98.18%～98.86%;与6个已知国外CPsV分离物的外壳蛋白基因核苷酸序列相似性为85.83%～95.23%,其对应氨基酸序列相似性为94.09%～99.32%。系统进化分析显示CHN-1、CHN-2和CHN-3与地中海沿岸国家的CPsV分离物聚为一簇,可能具有共同的起源。

分类号： S436.66

  • 相关文献

[1]柑橘鳞皮病毒RT-LAMP检测方法的建立与应用. 李敏,周天宇,吴佳星,周彦,曹孟籍,李中安. 2019

[2]猪的全基因组范围内Fox转录因子家族的识别和进化分析. 宫磊,王志鹏,高会江. 2010

[3]利用模糊搜索获得柑橘全基因组抗病基因同源序列的初步研究. 张艳芳,温寿星,黄镜浩,包榕,蔡子坚. 2014

[4]一步法RT-PCR检测柑橘鳞皮病毒. 吕婵娟,周常勇,周彦,唐科志,李小松. 2007

[5]运用一步法RT-PCR检测柑橘鳞皮病毒及其在橘橙不同部位中的全年分布. 吕婵娟,周常勇,周彦,唐科志. 2007

[6]野生黄花白芨的组织快繁及分子鉴定. 陶刚,朱英,刘作易,毛堂芬. 2008

[7]中国榕属榕亚属植物的系统发育初探. 赵南先,郝刚,陈贻竹. 2009

[8]猪LXRα基因的克隆、序列分析及表达研究. 于浩,刘娣,丁镌. 2009

[9]河西走廊酒泉地区盐碱土壤中可培养放线菌多样性. 李海云,胡磊,牛世全,孔维宝,达文燕,韩彩虹,阎薇如,耿晖. 2015

[10]不同地理种群银杏大蚕蛾COI基因序列变异与遗传分化. 杨宝山,候庆君,王欢,李喜升,姜德富,刘彦群,秦利. 2009

[11]柑橘黄龙病菌核糖体蛋白基因的多态性及系统发育分析. 鹿连明,范国成,姚锦爱,胡秀荣,陈国庆. 2011

[12]一株新的胡萝卜软腐欧文氏菌的分离和鉴定. 远方,屈淑平,崔崇士,曹鸣庆,马荣才. 2004

[13]蓝叶虫微孢子虫RPB1基因片段序列的测定及其系统发育分析. 燕薇,沈中元,唐旭东,徐莉,李前龙,肖圣燕,乐亚杰,付绪亮. 2014

[14]不同地理种群麦长管蚜3种次级共生菌检测与系统发育分析. 罗晨,胡祖庆,于永昂,杨杰,张改生,赵惠燕. 2015

[15]两个马铃薯Y病毒黑龙江马铃薯分离物株系鉴定. 程林发,张凤桐,姜瀚林,白艳菊,耿超,李向东. 2019

[16]桃蛀螟CpunPBP2基因的全长序列克隆、分子结构及系统发育分析. 朱秀云,徐鹿,王志强,陈耕,李进步,张亚楠. 2017

[17]一株PVY~(NTN-NW)黑龙江马铃薯分离物的检测鉴定. 张凤桐,程林发,耿超,田延平,原雪峰,白艳菊,李向东. 2019

[18]花生新黑地珠蚧发生为害及其系统发育. 李绍建,王娜,崔小伟,高蒙,桑素玲,范腕腕,王振宇. 2019

[19]新疆地区亚洲玉米螟中Wolbachia共生菌的检测和鉴定. 李菁,汪洋洲,张小飞,刘津,白明皓,王振营. 2018

[20]基于线粒体基因组数据的扁甲系总科间系统发育关系分析. 唐培安,李敏,冯润秋,王娟,刘蔓文,王亚洲,袁明龙. 2019

作者其他论文 更多>>

微信小程序