基于RNA-Seq的向日葵脂肪酸合成基因筛选与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 郭树春

作者： 郭树春;张艳芳;李素萍;邵盈;邢慧军;于海峰

作者机构：

关键词： 向日葵;脂肪酸;RNA-Seq;分子机制

期刊名称： 西北植物学报

ISSN：

年卷期： 2023 年 010 期

页码： 1663-1673

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为解析向日葵主要脂肪酸组分的生物合成分子机制，选用高油酸自交系J9、低油酸自交系P50为研究材料；进行错期播种同期采样试验，以液相色谱测定授粉后不同样品籽粒的脂肪酸组分与含量；利用RNA-Seq技术对不同样品测序，获得各样品与脂肪酸合成相关的基因表达数据，以气象学数据、液相色谱数据、向日葵基因组数据和转录组数据为基础，采用生物信息学方法分析相关数据。结果表明，（1）高油酸向日葵材料脂肪酸组分和含量受温度影响小，而低油酸材料易受温度影响；（2）J9和P50的12个样本的高表达基因数在7 500个左右，而中、低表达基因数相当，是高表达基因的2倍，约15 000个；（3）品种特异性表达基因和品种间特异表达基因去除重复后，在J9和P50在-CK和S数据集得到15 885个，GO功能富集获得的与脂质代谢直接相关的403个DEGs映射到与的脂质代谢相关的KEGG代谢通路，累计29个DEGs直接参与了19条相关KEGG通路。

分类号： S565.5

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