半巢式多重PCR法对A组轮状病毒VP7基因的分型

文献类型： 中文期刊

第一作者： 谷长维

作者： 谷长维;胡博

作者机构：

关键词： 轮状病毒;VP7基因型;半巢式多重PCR;引物设计

期刊名称： 中国生物制品学杂志

ISSN： 1004-5503

年卷期： 2021 年 002 期

页码： 213-215

收录情况： CSCD

摘要： 目的采用半巢式多重PCR法对A组轮状病毒（group A rotavirus,RVA）VP7基因进行分型。方法根据GenBank中RVA VP7基因5′端保守区设计合成多组基因分型引物,提取11个RVA代表流行毒株病毒的RNA,采用半巢式多重PCR方法进行RVA的VP7基因分型,使用BLAST在线软件与GenBank上相应VP7核苷酸序列比对。结果经琼脂糖凝胶电泳鉴定,11株RVA的多重PCR产物大小均与预期一致,能正确鉴别具有代表性的流行毒株VP7基因型[G1、G2、KN105（Wa-like G3）、To16-01（equine-like,DS-1-likeG3）、G4、G8、G9及G12];经BLAST在线软件比对,RVA病毒株VP7基因序列与设计的上游引物匹配,并与下游引物互补,引物特异性良好。结论利用设计的引物成功建立的半巢式多重PCR方法能正确识别RVA的VP7基因型。

分类号： R373.2

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