辣椒果实类胡萝卜素调控因子转录组和靶向代谢组分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 段敏杰

作者: 段敏杰;李怡斐;王春萍;杨小苗;黄任中;黄启中;张世才

作者机构:

关键词: 辣椒;类胡萝卜素;转录组;靶向代谢组;加权基因共表达网络分析;转录因子

期刊名称: 园艺学报

ISSN: 0513-353X

年卷期: 2024 年 008 期

页码: 1773-1791

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 分析了辣椒自交系1189不同发育时期果实转录组和类胡萝卜素靶向代谢组,基于加权基因共表达网络分析(weight gene co-expression network analysis,WGCNA)鉴定了可能参与调控辣椒类胡萝卜素生物合成相关基因的转录因子。靶向代谢组共鉴定出60种类胡萝卜素代谢物,分析发现,幼果期和绿熟期果实类胡萝卜素主要组分均为叶黄素(73.4%和64.5%),转色期叶黄素含量急剧下降,红熟期主要为辣椒红素(32.5%),无法检测到叶黄素。转录组分析共鉴定出14 148个差异表达基因和15个类胡萝卜素代谢相关差异表达基因。通过WGCNA将筛选所得的12286个差异表达基因划分至16个模块,发现MEdarkseagreen4、MElightcyan1和MEbrown2模块与11种主要类胡萝卜素组分显著相关。基于3个模块中类胡萝卜素相关差异表达基因构建代谢调控网络,并通过分析启动子结合基序,筛选出bHLH48、SEP3、CMB1、AGL27、YABBY2、GT-3B、NF-YA3、NAC2、HOX5和GATA26等10个转录因子可能在类胡萝卜素积累中发挥重要调控作用。

分类号: S641.3

  • 相关文献

[1]柚芽变株系类胡萝卜素代谢差异基因的转录组学分析. 潘鹤立,潘腾飞,佘文琴,徐世荣,李小婷,黄汉唐,陈源,吴少华,潘东明. 2020

[2]大蕉果实转录组学分析及类胡萝卜素合成相关基因的研究. 韩树全,罗立娜,魏鹏程,卢振亚,贺尔奇,刘凡值. 2024

[3]利用WGCNA进行棉花果枝节间伸长相关基因共表达模块鉴定. 巨飞燕,巨飞燕,张思平,刘绍东,马慧娟,陈静,葛常伟,沈倩,张小萌,刘瑞华,赵新华,张永江,庞朝友. 2019

[4]辣椒不同发育时期果实着色的转录组分析. 秦于玲,申龙斌,曹振木. 2020

[5]黄肉猕猴桃中果皮和内果皮不同时期比较转录组分析. 李明章,孙淑霞,李靖,陈栋,宋海岩,江国良,廖明安. 2019

[6]黄肉苹果转色期前后类胡萝卜素合成相关差异表达基因鉴定. 宋成秀,张利义,张彩霞,田义,丛佩华. 2017

[7]兰花花色化学及相关功能基因研究进展. 李崇晖,仇键,杨光穗,王存,黄素荣. 2013

[8]烟叶衰老过程中类胡萝卜素代谢及相关基因表达分析. 文利超,吴凤燕,李伟,郭永峰. 2019

[9]低温胁迫下苦瓜叶片转录组差异基因分析及生理响应特征. 杜文丽,陈中钐,许端祥,徐同伟,高山,温庆放. 2021

[10]黄麻(Corchorus capsularis L.)干旱胁迫转录组初步分析. 金关荣,陈杰,安霞. 2020

[11]紫花苜蓿响应低温胁迫转录因子的鉴定及表达分析. 齐晓,闵学阳,张正社,孙启忠,刘文献. 2017

[12]基于转录组分析不同着色桃果皮花青苷表达模式与转录因子. 何平,李林光,王海波,常源升. 2019

[13]盐胁迫条件下花生转录因子表达分析. 赵小波,闫彩霞,李春娟,王娟,姜常松,单世华. 2017

[14]木豆响应低温胁迫差异表达基因分析. 唐军,丁西朋,陈志坚,马向丽,毕玉芬,郭凤根. 2022

[15]旱胁迫和复水处理后马铃薯转录因子的转录组分析. 巩檑,张丽,聂峰杰,陈虞超,甘晓燕,石磊,宋玉霞,郭志乾,王峰. 2015

[16]低温胁迫下枇杷不同发育阶段的花果转录组比较分析. 徐红霞,周慧芬,李晓颖,姜路花,陈俊伟. 2021

[17]全基因组DNA甲基化和转录组联合分析鉴定杜梨耐盐相关转录因子. 李慧,张雨峰,李晓刚,王中华,蔺经,常有宏. 2023

[18]低氮胁迫下芝麻差异表达转录因子基因的分析. 张鹏钰,苏小雨,高桐梅,李丰,田媛,王东勇,卫双玲. 2023

[19]叶面喷施脱落酸对黄瓜果实品质的影响. 梁颖,张泽锦,王力明,唐丽,高佳. 2023

[20]秋茄低温胁迫转录组分析及脱落酸信号途径基因挖掘. 郭晋敏,杨升,刘星,王金旺,王文卿,陈秋夏. 2023

作者其他论文 更多>>