甘蓝型油菜分枝角度QTL定位及候选基因分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赵小珍

作者： 赵小珍;赵卫国;张春;余坤江;彭门路;陈锋;张维;孙程明;李保军;王灏;王晓东;张洁夫

作者机构：

关键词： 甘蓝型油菜;分枝角度;QTL;候选基因

期刊名称： 中国油料作物学报

ISSN： 1007-9084

年卷期： 2022 年 44 卷 001 期

页码： 25-34

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 分枝角度是油菜重要株型性状.为筛选和发现适度紧凑的分枝角度调控基因,以提高产量利于机械化收获,以分枝角度差异显著的油菜品种Holly和APL01为亲本构建的重组自交系(RIL)群体为材料,在2个环境中对分枝角度进行QTL定位及候选基因分析.结果表明,RIL群体分枝角度表现出连续变异且呈正态分布.利用前期构建的高密度SNP遗传连锁图谱,结合2环境中分枝角度表型数据进行QTL定位分析,共定位到8个分枝角度QTL,分别位于A9、C3、C4和C7染色体上,单个QTL可解释的表型变异范围为4.05%~9.60%.与前人研究结果比较,本研究定位了2个新的稳定表达的QTL,cqBA.C4-2和cqBA.C4-3,分别在2个环境中解释表型变异的5.13%~6.80%和4.60%~7.21%.根据Holly和APL01的重测序结果,在cqBA.C4-2置信区间(10.32~14.3 Mb)内共发现7226个SNP和829个InDel,其中7226个SNP中包含220个非同义突变和5个stopgain突变,829个InDel中有15个造成移码突变,这些突变位点共对应55个基因;在cqBA.C4-3置信区间(44.39~44.46 Mb)内共发现416个SNP和65个InDel,其中416个SNP中包含50个非同义突变,65个InDel中有1个造成移码突变,这些突变位点共对应15个基因.根据拟南芥同源基因的功能注释,共筛选到4个分枝角度相关的候选基因,BnaC04g13100D、BnaC04g15900D、BnaC04g16280D和BnaC04g44330D,期待为揭示油菜分枝角度的调控机制,通过分子设计方法培育株型紧凑的油菜品种提供参考.

分类号： S565.4

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