棉花盐胁迫下叶片miRNAs的鉴定与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 彭振

作者： 彭振;龚文芳;何守朴;庞保印;杜雄明

作者机构：

关键词： 盐胁迫;miRNA;小RNA测序;靶基因预测

期刊名称： 棉花学报

ISSN： 1002-7807

年卷期： 2014 年 26 卷 05 期

页码： 377-386

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： microRNAs(miRNAs)是一类21~24个核酸长度的非编码小分子RNA(sRNA,small RNA),通过介导目标mRNA的切割或者抑制翻译来调节植物基因的表达。本文利用200 mmol·L-1NaCl分别处理3叶期耐盐品系早熟长绒7号和盐敏感品系南丹巴地大花4 h,构建了4个小RNA文库并测序。以雷蒙德氏棉(Gossypium raimondii L.)D5基因组和本实验室陆地棉(Gossypium hirsutum L.)盐胁迫转录组测序拼接得到的序列作为参考,共发现360个miRNA,包括308个保守的miRNA和52个可信度高的新miRNA。2个品系共出现94个差异表达的miRNA,表达模式可分为2大类,筛选出20个候选miRNA。KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)分析表明,耐盐品系显著富集的信号通路是抗原加工过程,而盐敏感品系显著富集的是生物碱合成途径。

分类号： S562

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