水稻协优9308重组自交系群体白叶枯病抗性的全基因组关联分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 赵海涵
作者: 赵海涵;练旺民;占小登;徐海明;张迎信;程式华;楼向阳;曹立勇;洪永波
作者机构:
关键词: 水稻白叶枯病;全基因组关联分析;NBS-LRR;抗病育种
期刊名称: 作物学报
ISSN: 0496-3490
年卷期: 2022 年 48 卷 001 期
页码: 121-137
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 白叶枯病是水稻生产最严重的细菌性病害,挖掘新的白叶枯病抗性基因资源并培育抗病品种是控制该病害的重要方法.本研究利用父母本抗性差异较大的协优9308衍生的139个重组自交系群体作为遗传材料,人工接种不同白叶枯菌后的病斑长度作为连续型表型,结合经DNA深度测序获得的476,505个单核苷酸多态性(single-nucleotide polymorphism,SNP)标记进行全基因组关联分析(genome-wide associated study,GWAS).结果表明在P<1×10-4下,4个菌株处理后共鉴定到109个与白叶枯抗性显著关联的SNPs位点,解释表型变异率59.78%~63.29%.其中CR4接种发现了25个SNP位点其贡献率为61.00%,在这些SNP位点附近共筛选到19个基因,其中有2个为NBS-LRR抗病相关基因(LOC_Os11g43420和LOC_Os11g45930).表达分析验证发现该2个基因在抗性亲本中恢9308的表达量分别为感病母本协青早B的4.42倍和8.86倍,表明其可能在正调控白叶枯病抗性机制中发挥重要作用.进化树分析发现这2个候选基因与已克隆的抗性基因属于不同的亚组,表明可能是新基因.本研究为进一步挖掘白叶枯抗性基因和培育抗病品种提供了理论基础和基因资源.
分类号: S435.111.47
- 相关文献
作者其他论文 更多>>
-
十堰猕猴桃溃疡病病原鉴定及防治试验
作者:蔡高磊;周炀;张含;常威;任娇;曹立勇;汪华
关键词:猕猴桃溃疡病;丁香假单胞菌猕猴桃致病变种;避雨栽培;防治效果
-
近年我国水稻遗传育种研究进展与展望
作者:占小登;王凯;曹立勇
关键词:水稻;遗传育种;理论;品种;种业;进展;展望
-
腐植酸对水稻产量、品质及土壤特性的影响
作者:赵振东;孙廉平;曹正男;宁晓海;曹立勇
关键词:腐植酸;水稻;生长发育;稻米品质;土壤特性
-
水稻典败型隐性核雄性不育突变体ap90的鉴定与基因定位
作者:陈驰;陈代波;孙志豪;彭泽群;Adil Abbas;贺登美;张迎信;程海涛;于萍;马兆慧;宋建;曹立勇;程式华;孙廉平;占小登;吕文彦
关键词:水稻;隐性核雄性不育;ap90;Mut-Map;表达模式分析
-
水稻类病斑突变体lm8015-2的鉴定与基因的精细定位
作者:王晨;王备芳;张迎信;曹永润;张越;江敏;边康吉;张小惠;刘群恩
关键词:水稻;类病斑突变体;精细定位
-
水稻特大粒种质BG1和优质恢复系华占的粒形基因研究及相关功能标记开发
作者:龚柯;薛炮;温小霞;廖飞飞;孙滨;彭泽群;程式华;曹立勇;张迎信;吴玮勋;孙廉平;占小登
关键词:粒形;粒长;粒宽;粒重;功能标记
-
长粒优质香稻玉针香的基因型分析(英文)
作者:龚柯;孙廉平;张迎信;曹正男;赵振东;周政;赵正洪;占小登
关键词:玉针香;水稻;功能标记;粒形;稻米品质;香味