基于叶绿体DNA序列的Ceratotropis亚属遗传进化研究

文献类型: 中文期刊

第一作者: 刘岩

作者: 刘岩;程须珍;王丽侠;王素华;白鹏

作者机构:

关键词: Ceratotropis亚属;叶绿体DNA;序列差异;遗传进化

期刊名称: 作物学报

ISSN: 0496-3490

年卷期: 2013 年 39 卷 06 期

页码: 979-991

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 作为Ceratotropis亚属起源中心之一,中国有丰富的Ceratotropis亚属种质资源,但种间遗传进化研究相对落后。为探索该亚属各种间的亲缘关系及遗传演化规律,对Ceratotropis亚属18个种及亚种共110份材料的叶绿体基因组2个内含子(rpl16、rps16)和3个基因(psbA-trnH、rpoB-trnC和trnL-trnF)的间隔区序列进行了研究。结果表明,各序列的信息位点百分率在3.63%~24.28%之间,其中rps16最高,rpoB-trnC最低。序列拼接的Kimura进化距离分析发现,各种间进化距离介于0~0.057之间,V.minima复合体(V.minima、V.riukinensis和V.nakashime)和V.subramaniana的进化距离最大。基于单个序列,利用MEGA5.1和PAUP4.0软件构建的邻接树和最大简约树的结果均将Ceratotropis亚属18个种及亚种划分为2个大支,其中第I类包含9个种和亚种,为3个组(Angulares、Ceratotropis和Aconitifoliae)的混合体,第II类也包含9个种和亚种,全部属于Angulares组。系统发育树的分化同质性检验表明其拓扑一致性较高(P=0.87)。psbA-trnH等5个序列的分子系统进化研究对阐明Ceratotropis亚属种间亲缘关系和系统演化具有重要的理论和现实意义。

分类号: S643.1

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