基于高通量测序的藜麦连作根际土壤微生物多样性研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 董艳辉

作者： 董艳辉;于宇凤;温鑫;王亦学;聂园军;侯丽媛;李亚莉;刘江;任元;王育川;曹秋芬;吴慎杰;王斌;秦永军

作者机构：

关键词： 藜麦;连作;高通量测序;根际土壤;生物多样性

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2019 年 02 期

页码： 205-211

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了揭示连作藜麦土壤细菌群落结构和多样性的变化,采用高通量测序技术(Illumina-MiSeq)对不同处理(种植1 a、种植2 a)的连作藜麦根际土壤细菌进行16S rRNA基因V4区测序。结果表明,种植1 a较种植2 a的藜麦根际土壤细菌群落丰度和多样性指数都要高,其中,种植1 a较种植2 a的藜麦Chao1指数平均值增加16.4%,ACE指数平均值增加22.9%,Shannon指数平均值增加2.3%;菌群的分类学组成分析结果表明,重茬种植后,伦茨氏菌属、溶杆菌属、中慢生根瘤菌属、丛毛单菌属多样性增多;分枝杆菌属、藤黄单胞菌属、芽单胞菌属、浮霉状菌属等细菌多样性减少。功能预测分析表明,重茬种植后,编码细胞膜转运的功能基因、编码翻译、复制和修复的功能基因、编码外源性物质降解和代谢、多糖生物合成和代谢的功能基因大量减少,编码核苷酸代谢、萜类化合物的代谢、辅因子和维生素的代谢等功能基因少量减少;而编码信号转导和脂类代谢的功能基因有少量增加。

分类号： S154.3`S519

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