拟南芥miRNA及其靶序列配对特征分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘冲

作者： 刘冲;孙杰;范云六;王磊

作者机构：

关键词： 拟南芥;基因沉默;RNAi;微小RNA;人工小RNA

期刊名称： 中国农业科技导报

ISSN： 1008-0864

年卷期： 2009 年 11 卷 04 期

页码： 57-61

摘要： microRNAs(miRNAs)是真核生物中一类长度约为22 nt的非编码小分子RNA,miRNA与AGO等蛋白形成RISC沉默复合体,通过剪切或翻译抑制对靶基因起负调控作用。对拟南芥miRNA序列及其配对的靶序列间的特征进行了统计分析,结果表明miRNA序列5′端富含A、U,第1、第19碱基位对U、C具有较强的倾向性;miRNA与靶序列间常有1~4个碱基错配,错配碱基常出现在第1,第2和第21位,而第3~第6,第9~第10,第16~第17碱基配对较为保守,为人工合成miRNA的设计及miRNA靶基因的预测以提供了依据。

分类号： Q943.2

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