花生赤霉素代谢途径中三个基因家族鉴定与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 朱丹青

作者： 朱丹青;向雪林;汪柏丞;禹晨晏;徐国凤;袁鹏辉;刘登望;曾宁波;罗梓楠;李林

作者机构：

关键词： 花生;DELLA;GID1;GID2;基因家族;生物信息学分析;赤霉素代谢途径

期刊名称： 花生学报

ISSN： 1002-4093

年卷期： 2024 年 53 卷 004 期

页码： 15-27

摘要： 为了探究花生赤霉素代谢途径中3个基因家族DELLA、GIBBERELLIN INSENSITIVE DWARF1(GID1)、GIBBERELLIN INSENSITIVE DWARF2(GID2)在花生中的功能，利用生物信息学方法对其进行鉴定，并系统分析其理化性质、定位信息、基因结构、蛋白结构、保守基序、系统进化树、顺势作用元件及表达模式。结果表明，花生DELLA基因家族包含6个成员，均有共同的保守基序且都含有DELLA或DELLA superfamily结构域，外显子均有1个；花生GID1基因家族有57个成员，都含有Abhydrolase＿3结构域，但仅有3个共有的保守基序；花生GID2基因家族成员11个，都含有F-box的结构域且外显子均有1个，但仅有3个共有的保守基序。3个基因家族在染色体上呈不均匀分布，且在染色体两端分布的数量较多；系统进化分析发现，赤霉素代谢途径的3个基因都与大豆的亲缘关系较近，其启动子区域含有大量的顺式作用元件，花生赤霉素代谢途径中51.35%基因家族成员有赤霉素响应元件；大多赤霉素响应元件的基因在各个组织中表达水平低，部分基因主要是在籽仁和果皮的发育阶段表达较高。以上研究丰富了我们对花生赤霉素代谢途径中DELLA、GID1、GID2基因家族的理解，为后续花生赤霉素代谢途径中3个基因家族功能研究奠定了基础。

分类号： S565.2

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