辣椒Whirly基因家族的鉴定及表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 吕艳艳
作者: 吕艳艳;魏小春;赵艳艳;原玉香;王志勇;杨双娟;郑小兰;姜俊;李艳;张梦园;姚秋菊;张强;张晓伟
作者机构:
关键词: 辣椒;Whirly基因家族;全基因组鉴定;胁迫;表达分析
期刊名称: 华北农学报
ISSN: 1000-7091
年卷期: 2019 年 02 期
页码: 72-78
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为了探索辣椒Whirly基因家族成员的功能和进化关系,通过生物信息学分析了其基因结构、保守基序、进化关系及表达模式,通过荧光定量PCR测定其在脱落酸、高温、低温、疫病等胁迫下的表达量。结果表明,从辣椒CM334中鉴定了2个Whirly基因家族成员,CaWHY1和CaWHY2。辣椒CaWHY1和CaWHY2同其他物种Whirly基因理化性质相比,差别不大,结构相似性高,CaWHY2基因和番茄的SlWHY2基因结构完全一样,在系统进化树中聚在一起。CaWHY1与SlWHY1聚在一起,但它们的基因结构不同,说明Whirly蛋白在进化过程中,结构保守。表达模式分析发现,CaWHY1和CaWHY2在辣椒CM334中均能表达,但在不同组织和果实发育时期的表达水平存在差异。CaWHY1和CaWHY2在不同胁迫处理下受到不同程度的诱导,其中CaWHY1明显受疫病的诱导,CaWHY2在低温处理和脱落酸胁迫下的表达量变化趋势相反。由此可知,Whirly基因家族在辣椒的生长发育中起调控作用,在各种逆境胁迫中也发挥一定作用。
分类号: S641.3
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