稻瘟病菌Pot2引物扩增的部分片段同源性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 熊如意

作者： 熊如意;周益军;白娟;程兆榜;黄建丽

作者机构：

关键词： 稻瘟病菌;Pot2rep-PCR;同源性

期刊名称： 农业生物技术学报

ISSN： 1006-1304

年卷期： 2005 年 13 卷 06 期

页码： 111-114

收录情况： CSCD

摘要： 用Pot2-rep-PCR方法获得的稻瘟病菌(Magnaporthegrisea)指纹图谱基本反映了中等重复倒位单元Pot2的拷贝数和在基因组中的分布,理论扩增最短片段长度应为1199bp。而在江苏和中国北方来源粳稻菌株中常发现有600bp左右长度的条带。经回收测序该片段P1长度为606bp,其中Pot2-1端384bp命名为S1,与Pot2的对应序列完全同源,Pot2-2端222bp命名为S2,与Pot2对应序列同源性达89.3%。以P1及Pot2引物对可扩增的理论片段范围内的另一新扩增片段P2作为探针分别与10个DNA指纹差异明显并均含606bp片段的菌株PCR产物进行Southern杂交,结果为P1与Pot2rep-PCR产物的每条带均有同源性,而P2与扩增产物的最小条带没有同源性,认为P1片段的产生原因为Pot2片段的部分缺失或者部分片段在基因组中移动后整合到另一个Pot2之前。

分类号： S435.111.41

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