杂交粳稻花优14及其亲本孕穗期剑叶的基因表达谱芯片分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 储黄伟

作者： 储黄伟;牛付安;程灿;周继华;王新其;罗小金;袁勤;曹黎明

作者机构：

关键词： 水稻;杂交粳稻;杂种优势;基因芯片;光合作用

期刊名称： 遗传

ISSN： 0253-9772

年卷期： 2015 年 37 卷 09 期

页码： 932-938

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本文以孕穗期的杂交粳稻花优14及其母本申9A和父本繁14的剑叶为材料,利用Affymetrix水稻基因组芯片检测了3个样品中的基因表达谱,并用生物信息学方法对差异表达基因进行了分析。结果表明:与其亲本相比,杂交粳稻花优14中共有2057个基因的表达水平出现了2倍(变化倍数≥2或≤0.5)以上的变化。通过对这些差异表达基因进行GO(Gene Ontology)功能分类,发现差异表达基因在光合系统Ⅰ、叶绿体膜和叶绿体被膜等与叶绿体相关的细胞组分中显著富集;同时差异表达基因还在叶绿素合成、叶绿素代谢和类胡萝卜素合成等生物学过程中富集。光合作用效率的改变可能和花优14杂种优势的形成相关。与已报道结果不同,本文在代谢途径分析结果中并没有发现花优14中差异表达基因在碳固定和光合作用等途径中显著的富集,但是发现差异表达基因在光合作用-天线蛋白以及淀粉和蔗糖的代谢途径中显著富集。该结果表明,在不同的杂交组合中,参与杂种优势形成的基因或者代谢途径可能是不同的。

分类号： S511.22

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