肉种鸭抗沙门氏菌感染受选择基因分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 朱春红

作者： 朱春红;刘宏祥;王志成;顾昊天;陶志云;曾涛;宋卫涛;徐文娟;章双杰;古丽娜·艾山;王逸飞;李慧芳

作者机构：

关键词： 肉种鸭;抗沙门氏菌感染;全基因组;受选择基因

期刊名称： 中国家禽

ISSN： 1004-6364

年卷期： 2025 年 47 卷 010 期

页码： 148-154

收录情况： 北大核心

摘要： 为探讨鸭抗沙门氏菌感染可能机制，试验使用选择信号分析方法鉴定与抗沙门氏菌感染相关的候选基因，为肉鸭抗病育种提供参考。试验选择肉种鸭群体中沙门氏菌抗体高低差异的肉种鸭80只（沙门氏菌抗体高低组各40只）个体，采集翅静脉血，利用T7基因测序仪进行10×深度测序，采用XP-EHH方法对获得的高质量SNPs位点鉴定基因组显著差异区域，挖掘全基因组范围内潜在的抗沙门氏菌感染相关基因。结果显示：对SNPs位点质控后共获得445 530个SNPs,XP-EHH方法筛选到288个受选择基因；GO富集分析发现基因ANAPC5、CDK1、MYO6、DCTN1、PPP2R2D、HSPA2、SCX、TWF2、DCUN1D1、PTPRS、HIF1A、PTPRS、HAGHL被富集到生物学过程、细胞组分或分子功能前10条通路中；KEGG富集通路中与细菌感染或者免疫系统相关的通路主要有沙门氏菌感染、c型凝集素受体信号通路、RIG-I样受体信号通路、Toll样受体信号通路、NOD样受体信号通路，涉及的基因有AKT3、PIK3C2B、ITPR3、MYO6、DCTN1、CALML4、AZI2。综上所述，在肉种鸭中筛选到可能与鸭抗沙门氏菌抗性相关基因20个，初步从全基因组学角度揭示肉种鸭抗沙门氏菌感染遗传机制，为后续肉鸭抗病育种奠定了基础。

分类号： S834.2

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