猪圆环病毒Ⅱ型结构蛋白的二级结构及其B细胞抗原表位预测

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘光清

作者： 刘光清;倪征;云涛;梁华丽;华炯刚;李双茂;杜清云

作者机构：

关键词： 口蹄疫病毒;结构蛋白;B细胞表位;二级结构

期刊名称： 中国预防兽医学报

ISSN： 1008-0589

年卷期： 2005 年 27 卷 006 期

页码： 462-464

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究以猪圆环病毒(PORCINE CIRCOVIRUS,PCV)Ⅱ型的基因组序列为材料,采用GAMIER-ROBSON方法、CHOU-FARPLUS 方法和KARPLUS-SCHULZ方法预测了其结构蛋白的二级结构,用KYTE-DOOLITTLE方法对结构蛋白的亲水性进行了分析,用EMINI方法预测了结构蛋白的表面可能性,以JAMESON-WOLF方法预测了蛋白的抗原指数.然后综合评价了PCV-2型结构蛋白的B细胞抗原表位.结果表明,PCV-2结构蛋白形成α螺旋结构的能力较差,但是该蛋白含有较多的β折叠和转角结构,因而该蛋白具有丰富的二级结构.分析结果还表明结构蛋白具有多处抗原指数较高的区段,其中羧基端含有潜在的B细胞优势抗原表位,因此其在免疫学中的地位也应当引起重视.本研究将为猪圆环病毒的反向疫苗学的研究提供一定的理论依据.

分类号： S852.65+9.2%Q753

  • 相关文献

[1]猪圆环病毒II型结构蛋白的二级结构及其B细胞抗原表位预测. 刘光清,倪征,云涛,梁华丽,华炯刚,李双茂,杜清云. 2005

[2]牛病毒性腹泻病毒结构蛋白基因的克隆及其B细胞抗原表位的预测. 何延华,黄新,薄新文,钟发刚,韩猛立,陈南颖,王新华. 2012

[3]口蹄疫病毒结构蛋白的二级结构及其B细胞抗原表位的预测. 云涛,刘光清,冷青文,郭慧琛,刘在新,张居农,谢庆阁. 2004

[4]蹄疫病毒株AF72 P1的结构分析. 陈启伟,王永录,杨孝朴. 2010

[5]FMDVAsia1/HeB病毒株结构蛋白基因的克隆测序及B细胞抗原表位预测. 张中旺,张永光,王永录,潘丽,方玉珍,刘力宽,蒋守田,吕建亮,周鹏,张昱,张淑刚,杜进鑫,李正丰. 2009

[6]口蹄疫病毒株AF72P1的结构分析. 陈启伟,王永录,杨孝朴. 2010

[7]口蹄疫病毒株AF72 P1的结构分析. 陈启伟,王永录,杨孝朴. 2010

[8]FMDV Asia1/HeB病毒株结构蛋白基因的克隆测序及B细胞抗原表位预测. 张中旺,张永光,王永录,潘丽,方玉珍,刘力宽,蒋守田,吕建亮,周鹏,张昱,张淑刚,杜进鑫,李正丰. 2009

[9]口蹄疫病毒Hankou/99株结构蛋白的二级结构及其B淋巴细胞表位的预测. 曾江勇. 2015

[10]类猪圆环病毒因子P1 VP2蛋白二级结构与B细胞表位预测. 温立斌,何孔旺,杨汉春,王玉然. 2009

[11]奥利亚罗非鱼DMO和DMT蛋白二级结构和B细胞抗原表位的预测. 曹谨玲,陈剑杰,俞菊华,吴婷婷. 2006

[12]鹅新型坦布苏病毒囊膜蛋白的二级结构与B细胞表位预测. 韩凯凯,李银,黄欣梅,赵冬敏,刘宇卓,谢星星,游园. 2014

[13]狂犬病病毒核蛋白基因生物信息学分析. 李江涛,胡亮,张金卫,殷相平,丁农,鲁新伟,吴明良,郑明亮,潘颂华. 2013

[14]狂犬病病毒CVS株糖蛋白、核蛋白生物信息学分析. 李江涛,殷相平,张金卫,丁农,柳纪省. 2010

[15]猪水疱病病毒外壳蛋白的二级结构和抗原表位预测. 孙世琪,刘湘涛,郭慧琛,尹双辉,刘在新,马军武,谢庆阁. 2006

[16]羊口疮病毒B2L蛋白二级结构及其细胞表位的预测. 王光祥,尚佑军,吕占禄,田宏,张克山,刘湘涛. 2012

[17]狂犬病病毒糖蛋白基因的克隆及其二级结构和B细胞抗原表位预测. 李江涛,殷相平,柳纪省,胡永浩. 2008

[18]福氏2a志贺菌DNA转录激活蛋白MarA的二级结构及其B细胞抗原表位预测. 魏小娟,张继瑜,王松泰,李剑勇,周旭正,牛建荣,李金善. 2009

[19]猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒反向遗传操作系统的建立及应用. 袁世山,孙志,余丹丹,高飞,吕键,袁海峰,郑海红,谭菲菲,张建武. 2007

[20]猪水泡病病毒结构蛋白基因的克隆及其蛋白二级结构和淋巴细胞表位的预测. 郑海学,刘湘涛,尚佑军,刘光清,白兴文,罗静初,谢庆阁. 2005

作者其他论文 更多>>

微信小程序