文献类型： 中文期刊
第一作者： 冷超粮
作者： 冷超粮;马秀秀;宋佳静;王佳宝;贾楠;田想;刘华;李峻婕;段竹君;刘思;翟洪月;张腾;史鸿飞;李娜;姚伦广;阚云超;田志军
作者机构：
关键词： 猪圆环病毒2型;流行病学调查;序列分析;Cap蛋白;遗传变异
期刊名称： 中国预防兽医学报
ISSN： 1008-0589
年卷期： 2024 年 46 卷 009 期
页码： 960-966
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 为了解河南省猪圆环病毒2型（PCV2）的流行及变异情况，本研究采集该地区规模化猪场2017年1月～2023年6月939份表现为繁殖障碍和呼吸道症状的病猪血液或组织样品，采用PCR方法进行PCV2检测。结果显示，PCV2总阳性率为31.42%（295/939）;2017年～2022年PCV2阳性率逐年降低，分别为58.65%（61/104）、49.48%（48/97）、28.57%（36/126）、16.15%（31/192）、11.52%（19/165）和7.87%（7/89），而2023年迅速上升，达到56.02%（93/166）。利用PCR扩增29份PCV2阳性样品的全基因组序列并测序，采用Meg Align分析PCV2流行株全基因组序列与Gen Bank中4株PCV2参考株全基因组序列的同源性；采用MEGA 11软件利用NJ法构建PCV2流行株ORF2基因与Gen Bank中24株PCV2参考株ORF2基因的系统发育树；采用Meg Align分析PCV2流行株Cap蛋白氨基酸序列的变异特征；采用RDP4和Sim Plot分析PCV2流行株全基因组的重组特征。全基因组同源性分析结果显示，本研究鉴定的PCV2全基因组序列之间的同源性为95.1%～100%，与PCV2参考株的同源性为93.7%～98.6%，其中与疫苗株PCV2a LG（HM038034）、PCV2b DBN-SX07-2（HM641752）和PCV2d SH（AY686763）的同源性分别为94.8%～96.2%、95.3%～98.6%和96.6%～97.8%，与来自丹麦的代表株PCV2c DK1980PMWSfree株（EU148503）的同源性为93.7%～95.1%。此外，两株2023年的PCV2流行株HN230522和HN231217与参考株的同源性仅为94.5%～97.9%。进化树结果显示，有19株PCV2流行株与PCV2d基因型参考株聚为一个分支，10株与PCV2b基因型参考株聚为一个分支。其中今年出现的PCV2流行株HN230522和HN231217株虽然属于PCV2d基因型，但处于一个相对独立的分支。Cap蛋白氨基酸序列分析结果显示，与疫苗株PCV2a LG（HM038034）、PCV2b DBN-SX07-2（HM641752）和PCV2d SH株（AY686763）相比，部分PCV2流行株在构象表位区（aa47～aa85和aa165～aa200）存在R48H、A59K/R、G85D、P151T、N178S、R180K和G197S的突变，在基因型特异性结构域（aa190～aa191/aa206/aa210）存在K206I的突变，且HN230522株在核定位信号区（NLS）(aa1～aa41)存在特有的V30L突变，HN231217株在基因型特异性结构域（aa89～aa91）存在特有的89RTV91残基。重组分析结果显示，有高达65.52%（19/29）的PCV2流行株存在疑似的重组片段，且重组片段全部位于ORF1中。上述结果表明，今年以来河南省猪场PCV2阳性率快速上升，且流行株出现了较大变异，应加强对PCV2流行动态和遗传变异的监测。本研究为河南省PCV2分子流行病学、疫苗研究提供了参考依据。
分类号： S858.28
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