红花质膜H+-ATPase基因家族成员鉴定及响应低氮低磷胁迫的表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 腊贵晓
作者: 腊贵晓;赵玉龙;代丹丹;余永亮;郭红霞;史贵霞;贾慧;杨铁钢
作者机构:
关键词: 红花;质膜H+-ATPase基因家族;生物信息学分析;低氮胁迫;低磷胁迫
期刊名称: 生物技术通报
ISSN: 1002-5464
年卷期: 2025 年 41 卷 008 期
页码: 220-233
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 【目的】对红花质膜H+-ATPase(CtPMA)基因家族进行全基因组鉴定与分析,为研究该基因家族及其在响应低氮低磷胁迫中的功能奠定基础。【方法】利用生物信息学方法对CtPMA基因家族成员进行鉴定和系统的分析;利用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)分析其组织表达特异性及在低氮低磷胁迫下的响应。【结果】在红花中共鉴定到10个CtPMAs(命名为CtPMA1-CtPMA10),其编码蛋白质的氨基酸数为785-958 aa,相对分子质量为85.23-105.52 kD,等电点为5.26-7.91,亚细胞位点预测显示全部位于细胞膜;都含有Cation_ATPase_N结构域、E1_E2 ATPase结构域和HAD-superfamily hydrolase subfamilyⅢA结构域;顺式作用元件预测显示CtPMA基因家族内广泛存在与生长发育、激素和胁迫相关的调控元件;基因共线性显示全基因组复制和片段复制在Ct PMA基因家族进化中起到了重要作用。RT-qPCR结果表明,在根中高表达的CtPMA1和CtPMA7的表达量显著受到低氮低磷胁迫的诱导,说明CtPMA1和CtPMA7可能与红花根部吸收氮磷的功能密切相关。【结论】红花全基因组中共鉴定到10个CtPMA基因,其进化相对保守,在不同的组织部位具有不同的表达模式。当红花遭受低氮低磷胁迫时在根部高表达的CtPMA1和CtPMA7的转录水平显著被诱导,暗示其通过诱导自身转录水平以提高对氮磷的吸收和利用效率,用来抵御营养等逆境胁迫。
分类号: S567.219%Q943.2
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