运用SNP-CAPS分子标记定位香菇重要功能基因的研究
文献类型: 中文期刊
第一作者: 黄杰
作者: 黄杰;谭琦;鲍大鹏
作者机构:
关键词: 香菇;功能基因;非同义SNP;SNP-CAPS标记
期刊名称: 上海农业学报
ISSN: 1000-3924
年卷期: 2015 年 02 期
页码: 13-17
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 根据香菇单核菌丝体135A和135B的全基因组测序,通过生物信息学方法分析筛选出香菇功能基因CAP、GLA1、TLG1结构域中的非同义SNP位点,开发出3对SNP-CAPS分子标记。结果表明:这3对功能基因SNP-CAPS分子标记可将23个香菇单核体供试菌株分成135A型(分别为16株、20株、2株)和135B型(分别为7株、3株、21株),这些标记表现出的多态性为进一步研究香菇菌株的来源和功能基因的定位提供参考价值;并建立起可以简单、快速、准确地调查重要功能基因的SNP位点变异情况的方法。
分类号: S646.12
- 相关文献
[1]香菇中CRISPR/Cas9基因编辑体系的构建. 付阳,宋春艳,董晶晶,刘建雨,姜宁,章炉军,于海龙,尚晓冬,谭琦. 2024
[2]曲霉有性生殖及相关功能基因的研究进展. 葛永怡,王玉臣,谭玉梅,任秀秀,刘永翔,刘作易. 2015
[3]功能基因组与绿色超级稻培育的研究进展. 余四斌,汤欣欣,罗利军. 2016
[4]RNA-Seq在AM真菌研究中的应用. 邓杰,李芳,张伟珍,段廷玉. 2019
[5]致病杆菌功能基因的分子生物学研究进展. 杨怀文. 2007
[6]我国鲆鲽类生殖内分泌研究进展. 柳学周,史宝,徐永江,王滨,刘新富,孟振. 2017
[7]野猪、松辽黑母猪及其杂交一代多性状功能基因分子遗传标记研究. 杨广礼,章焕,田慧月,刘志强,张志燕,孙家付,冯绍银,张树敏,李明. 2021
[8]水稻粒长遗传及其功能基因研究进展. 张静,李晨,潘大建,陈文丰,孙炳蕊,刘清,吕树伟,江立群,毛兴学,范芝兰. 2021
[9]龙脷叶转录组分析及黄酮类生物合成相关基因的挖掘. 徐世强,梅瑜,曹阳,黄志娜,蔡时可,王继华. 2020
[10]丛枝菌根真菌与有机肥配施对甜玉米根际土壤关键碳循环功能基因的影响. 袁银龙,孙杰,徐如玉,左明雪,顾文杰,卢钰升,解开治,徐培智. 2020
[11]秸秆还田对稻田氮循环微生物及功能基因影响研究进展. 王青霞,陈喜靖,喻曼,沈阿林. 2019
[12]桃主要性状的分子标记与功能基因定位研究进展. 连晓东,谭彬,郑先波,陈谭星,王婷,栗焕楠,冯建灿. 2018
[13]燕麦基因组学研究进展. 潘莹,程时锋. 2021
[14]一种基于PCR的水稻SNP标记检测方法. 王钰,许学,秦瑞英,陆徐忠,李莉,杨剑波,倪金龙,马卉,汪秀峰. 2020
[15]小麦分子育种研究进展IV.小麦相关分子标记. 韩斌,王长彪,任永康,赵兴华,董艳辉. 2015
[16]东南亚62个籼型水稻亲本SSR遗传多样性分析. 从夕汉,施伏芝,阮新民,张效忠,罗志祥. 2016
[17]兰花的功能基因. 张盛春,王小菁,叶庆生,朱根发. 2006
[18]氮磷添加对草甸草原土壤氮磷转化功能基因丰度的影响. 肖红,刘玉玲,刘忠宽,李鹏珍,戎郁萍. 2023
[19]克隆食用菌重要功能基因的研究进展. 陈辉,冯志勇,陈明杰,鲍大鹏. 2009
[20]小麦相关功能基因的全基因组电子定位及基因注释. 王长彪,韩斌,刘江,崔婷,任永康,赵兴华,董艳辉,李亚丽,唐朝晖. 2016
作者其他论文 更多>>
-
31份藜麦种质农艺性状及ISSR遗传多样性分析
作者:姚佳;杨发荣;刘文瑜;黄杰;魏玉明;杨超;刘欢
关键词:藜麦;农艺性状;遗传多样性;ISSR分子标记;聚类分析
-
金针菇菌丝体γ-氨基丁酸快速检测方法
作者:卢雪伟;李晓晖;鲍大鹏;周陈力;陈洪雨;冯占;李贺文;王瑞娟;邵悠然;吴莹莹
关键词:Γ-氨基丁酸;单因素试验;响应面;重复性分析;比色法
-
利用转录组初步探索曲古抑素A延缓香菇菌丝转色机制
作者:吴涛;鲍大鹏;王伟霞;仝乐涛;李福后;唐利华
关键词:转录组;组蛋白去乙酰化;香菇转色;曲古抑素A
-
异宗配合食用真菌双核体和单核体相关概念辨析
作者:鲍大鹏;徐建平;潘迎捷;谭琦
关键词:食用真菌;双核体;单核体;核相交替;性角色
-
中国珍稀食用菌产业发展现状与趋势
作者:董浩然;于海龙;周峰;陈辉;陈美元;张敏;唐杰;谭琦
关键词:珍稀食用菌;发展现状;存在问题;栽培模式
-
甘肃临夏高寒区饲用藜麦产草性能和营养价值
作者:黄杰;杨发荣;刘文瑜;魏玉明;谢志军;何振富;杨钊
关键词:藜麦;临夏;高寒区;饲草;生产性能;品质;相对饲用价值
-
利用转录组挖掘羊肚菌干旱胁迫相关基因
作者:仝乐涛;徐爱国;鲍大鹏;王伟霞;李福后;唐利华
关键词:羊肚菌;干旱;转录组;基因差异表达