洋桔梗(Eustoma grandiflorum)干旱胁迫转录组初步分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 安霞

作者： 安霞;朱强;楼旭平;李鲁峰;陈杰;柳婷婷;李文略;骆霞虹;朱关林;余利隽

作者机构：

关键词： 洋桔梗(Eustoma grandiflorum);干旱胁迫;转录组

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2022 年 01 期

页码： 24-30

收录情况： 北大核心

摘要： 洋桔梗(Eustoma grandiflorum)是一种原产于北美的重要观赏植物。到目前为止,关于洋桔梗的基础分子研究报道相对较少,特别是响应干旱胁迫的分子机制相关研究。本试验利用转录组二代测序技术对干旱胁迫下的洋桔梗幼苗进行了研究。结果表明,该转录组测序数据具有良好的质量控制结果。为了在此基础上获得基因信息,利用Trinity和Corset等软件将序列进行了拼接,共得到102 014条非冗余基因,其中包含2 929条编码基因,经分析发现分属于79个转录因子家族。对所有基因进行注释,发现比对相似度最高的物种是中果咖啡。最后,对基因序列进行简单序列重复(simple sequence repeat, SSR)分析,获得了所有非冗余基因以及转录因子编码基因所包含的SSR信息。本研究结果可为后续针对洋桔梗响应干旱胁迫的相关研究提供候选分子资源。

分类号： S682.19

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