地榆醇提物对对虾致病菌VP_(AHPND)生长影响及最适内参基因的筛选

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨泽禹

作者： 杨泽禹;廖梅杰;王印庚;张正;韦信贤;李彬;荣小军

作者机构：

关键词： 急性肝胰腺坏死病(AHPND);副溶血弧菌;地榆;内参基因;qRT-PCR

期刊名称： 渔业科学进展

ISSN： 2095-9869

年卷期： 2020 年 02 期

页码： 150-158

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为筛选适用于研究地榆(Sanguisorba officinalis L.)对对虾急性肝胰腺坏死病致病株副溶血弧菌(Acute hepatopancreatic necrosis disease caused by Vibrio parahaemolyticus, VP_(AHPND))抑制机理的内参基因,本文探究了地榆醇提物胁迫下VP_(AHPND)生长的变化,并利用qRT-PCR技术探究了该条件下VP_(AHPND)中6种常见内参基因(rec A、pvs A、pvu A、gapdh、16S rRNA和rpo S)的表达情况,利用GeNorm、Norm Finder、Best Keeper、Delta CT以及Ref Finder这5种方法对其表达稳定性进行了评估和筛选。结果显示,地榆醇提物能抑制VP_(AHPND)的生长,且抑制效果与浓度呈正相关。在不同浓度地榆醇提物处理条件下,这6种内参基因扩增产物特异性良好,其中,Ct值变化差异最小的为16S rRNA (CV=3.88),变化差异最显著的为pvs A (CV=12.53)。5种方法对6种内参基因稳定性排序略有差异,其中,GeNorm给出的稳定性排序为rpo S=16S rRNA> gapdh> rec A> pvu A> pvs A;Norm Finder结果为gapdh> rpo S> pvu A> 16S rRNA> rec A> pvs A;Best Keeper结果为16S rRNA> rpo S> gapdh> rec A> pvu A> pvs A;Delta Ct结果为gapdh> rpo S> pvu A> 16S rRNA> rec A> pvs A;Ref Finder综合排名结果为rpo S> gapdh> 16S rRNA>pvu A> pvs A> rec A。本研究根据配对变异系数结果,最终推荐同时使用rpo S和gapdh作为该条件下内参基因。本研究为以地榆为核心药物的AHPND防控技术的建立和从基因表达角度研究地榆对VP_(AHPND)的作用机理提供了基础。

分类号： S945.49

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