蛋鸡资源群体的小肠质量全基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李永峰

作者： 李永峰;王克华;窦套存;胡玉萍;郭军;王星果;马猛;曲亮

作者机构：

关键词： 蛋鸡;小肠质量;GWAS;遗传结构

期刊名称： 江苏农业科学

ISSN： 1002-1302

年卷期： 2022 年 50 卷 022 期

页码： 165-170

收录情况： 北大核心

摘要： 小肠是鸡重要的营养消化吸收器官,在蛋鸡生长和生产发挥重要作用,小肠质量是反映肠道发育情况的重要生理指标,有必要对其遗传结构进行研究.利用白来航鸡与东乡绿壳蛋鸡杂交构建F2代资源群体,采用600K鸡SNP芯片对F2代1512羽个体进行基因型检测,通过PLINK软件对小肠质量性状进行全基因组关联分析(GWAS).结果显示,十二指肠、空肠和回肠的遗传力分别为0.32、0.28、0.26,说明小肠质量表现出中等遗传力水平.GWAS共鉴定出185、201、36个SNP分别与十二指肠、空肠、回肠质量显著相关(共422个SNP),其中,421个SPN位于1号染色体166.6~173.2 Mb区域,说明该区域与小肠质量关系密切.共有28个SNP与3段小肠质量均显著相关,其中,6个SNP位于对应4个候选基因(FOXO1、CKAP2、CAB39L和MRPS31)的内含子区,它们可能与小肠质量密切相关.通过GWAS分析,初步筛选出与蛋鸡小肠质量性状相关的6个SNP和4个候选基因,可为性状的遗传机制解析和分子育种提供理论依据.

分类号： S831.2

  • 相关文献

[1]蛋鸡资源群体的盲肠长度全基因组关联分析. 王星果,曲亮,卢建,窦套存,马猛,胡玉萍,沈曼曼,郭军,李尚民,王克华. 2018

[2]蛋鸡直肠重量全基因组关联分析. 李永峰,王克华,胡玉萍,郭军,窦套存,王星果,马猛,曲亮. 2023

[3]中国籼稻群体的遗传结构解析及12个株型性状的全基因组关联分析. 鲁清,章孟臣,魏兴华. 2015

[4]基于通路分析剖析水稻农艺性状配合力和杂种优势. 向丽媛,徐凯,苏静,吴超,袁雄,郑兴飞,刁英,胡中立,李兰芝. 2019

[5]高粱抗丝黑穗病分子遗传机制研究进展. 白春明,陆晓春. 2017

[6]鸡重要性状全基因组关联分析研究现状及展望. 潘爱銮,皮劲松,申杰,吴艳,蒲跃进,梁振华,张昊,孙静,程妮,杜金平. 2017

[7]斑玉蕈栽培菌株遗传变异与生长速率GWAS分析. 龚明,李燕,鲍大鹏,尚俊军,杨瑞恒,周陈力,万佳宁,吴莹莹. 2021

[8]小麦芒基因定位及其与农艺性状的相关性分析. 李玲,刘盼,张蕾,张浩,贾继增,高丽锋. 2021

[9]基于通路分析方法诠释肉鸡体重性状全基因组关联研究. 王杰,刘璐,刘杰,赵桂苹,刘冉冉. 2017

[10]利用两种统计模型对中国肉用西门塔尔牛屠宰性状的全基因组关联分析. 常天鹏,夏江威,宝金山,金生云,朱波,徐凌洋,陈燕,张路培,高雪,李俊雅,高会江. 2018

[11]玉米叶片叶绿素含量的全基因组关联性分析. 滕守振,汪海,梁海生,辛红佳,李圣彦,郎志宏. 2017

[12]北京油鸡血清IgG含量的GWAS初步分析. 张磊,刘冉冉,赵桂苹,文杰,郑麦青,吴丹,胡耀东,李鹏,刘丽. 2011

[13]基于GBS技术开展柚类资源群体遗传评价并发掘酸含量相关基因. 江东,王旭,李仁静,赵晓东,戴祥生,柳正葳. 2023

[14]利用全基因组关联分析挖掘粳稻直链淀粉含量调控基因. 郑洪亮,孙世臣,丁国华,王彤彤,赵宏伟,王敬国,刘化龙,韩笑,邹德堂,来永才. 2021

[15]大豆低聚糖优异种质鉴定及GWAS分析. 李岩哲,熊雅文,许亚男,唐威,张红梅,张威,刘晓庆,王琼,许文静,张群,陈华涛. 2023

[16]黄瓜核心种质幼苗耐低温性评价及GWAS分析. 王伟平,宋子超,薄凯亮,董邵云,魏爽,苗晗,李锦斌,张圣平,顾兴芳. 2019

[17]黄瓜核心种质幼苗耐热性评价及GWAS分析. 魏爽,张松,薄凯亮,王伟平,苗晗,董邵云,顾兴芳,张圣平. 2019

[18]油菜籽脂肪组成的遗传结构剖析. 杨雨婷,于文凯,徐颖,王会,梅德圣,蒋立希,胡琼,刘佳. 2023

[19]冬小麦籽粒主要品质性状的全基因组关联分析. 董一帆,任毅,程宇坤,王睿,张志辉,时晓磊,耿洪伟. 2023

[20]黄瓜发芽期耐热性评价及全基因组关联分析. 张松,苗晗,宋子超,薄凯亮,王烨,顾兴芳,张圣平. 2019

作者其他论文 更多>>

微信小程序