不同来源大白猪总产仔数近交衰退评估

文献类型： 中文期刊

第一作者： 史良玉

作者： 史良玉;王立刚;张鹏飞;莫家远;李洋;王立贤;赵福平

作者机构：

关键词： 大白猪;总产仔数;连续纯合片段;近交系数;近交衰退

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN：

年卷期： 2021 年 010 期

页码： 2772-2782

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在评估两个不同来源大白猪群体经过近8个世代的选育后总产仔数（total number of piglets born, TNB）近交衰退的程度。本研究对1 937头大白猪使用GeneSeek GGP Porcine HD芯片进行分型,其中1 039头来自加系大白猪和898头来自法系大白猪,且两品系均有表型记录和系谱记录,系谱共由3 086头大白猪组成。分别使用系谱、SNP和ROH进行个体近交系数估计,并将近交系数作为协变量利用动物模型对总产仔数进行近交衰退评估。为了精准定位导致总产仔数衰退的基因组片段,又进一步对每条染色体以及显著染色体分段计算近交系数并估计其效应,检测是否能引起总产仔数发生近交衰退现象。对于加系群体,FROH、FGRM和FPED估计的近交系数均值分别为0.124、0.042和0.013,其中FROH和FPED相关最高,相关系数为0.358;对于法系群体,FROH、FGRM和FPED均值分别为0.123、0.052和0.007,其中FROH和FGRM相关最高,相关系数为0.371。利用3种不同计算方法所得近交系数用于估计近交衰退时,加系群体的总产仔数均检测到显著的近交衰退,而且当FROH、FGRM和FPED每增加10%时,总产仔数分别减少0.571、0.341和0.823头;但法系群体仅有FROH估计的总产仔数检测到显著近交衰退,FROH每增加10%时,总产仔数减少0.690头。为了锁定相关的染色体和基因组区段,首先利用ROH估计每条染色体近交系数并进行近交衰退分析发现,加系群体中检测到第6、7、8和13号染色体产生了显著近的总产仔数交衰退,而法系群体未检测到与近交衰退相关的染色体。然后,又将与加系总产仔数近交衰退显著相关的4条染色体平均分为2、4、6、8个片段进行近交衰退检测,其中平均分成8段后的染色片段的长度范围为15.1～25.8 Mb。在第6、7和8号染色体分别检测到1、2和3个与总产仔数相关的近交衰退染色体片段。这些区域注释到了CUL7、MAPK14和PPARD基因与胎盘发育相关,AREG和EREG基因与卵母细胞成熟有关。本研究利用3种近交系数计算方法对两个不同来源的大白猪总产仔数进行近交衰退评估,在加系大白猪中3种估计方法都能检测到近交衰退的现象,而法系群体中只有FROH才能检测到。而且通过ROH方法进一步确定了能引起加系大白猪总产仔数衰退的4条染色体和6个特定的染色体区段,还注释到了与繁殖相关的候选基因。这为揭示近交衰退的遗传机制提供了新的研究手段,也为基因组选种选配提供了参考依据。

分类号： S828

  • 相关文献

[1]肃南牦牛群体遗传结构、选择信号分析和ROH检测. 鲍麒,包鹏甲,马晓明,吴晓云,孟光耀,褚敏,曹红梅,郎建英,安玉峰,梁春年,阎萍. 2022

[2]蕨麻猪产仔性状全基因组关联分析. 张丰霞,杨德威,崔茂盛,李千军,闫峻,旦智草. 2024

[3]大白猪繁殖性状全基因组关联分析. 张宇,周佳伟,吴俊静,乔木,徐忠,李梓芃,彭先文,梅书棋. 2022

[4]猪产仔性状与雌激素受体基因PvuⅡ多态性效应的Meta分析. 段炼,王志鹏,高会江. 2011

[5]猪雌激素受体基因PvuⅡ酶切片段多态性与产仔性能的关系. 孟庆利,刘铁铮. 2005

[6]猪骨调素基因多态性对产仔性状的影响1. 孟庆利,刘铁铮. 2005

[7]猪总产仔数的方差分析和多重比较. 储明星,吴常信,张建生,顾建平,孙士铨. 2000

[8]骨形成蛋白15基因BcuⅠ多态性对猪产仔性能的影响. 吴井生,朱孟玲,陈超,陈明,李国辉. 2009

[9]中华卤虫不同近交水平家系生长性能比较. 喻驰方,栾生,张志伟,孔杰,张全启. 2013

[10]近交及其对水产养殖的影响. 马大勇,胡红浪,孔杰. 2005

[11]鸡繁殖性能近交衰退相关CpG岛差异甲基化基因的筛选. 薛倩,李国辉,殷建玫,张会永,周成浩,朱云芬,邢伟杰,苏一军,邹剑敏,韩威. 2021

[12]长白种猪优化选配减少近交畸形的研究. 陈清森,蔡更元,刘小红,陈瑶生. 2011

[13]虾夷扇贝F1自交衰退及其遗传调控机理. 赵亮,李仰平,高杉,姜苹哲,林杉杉,张国瀚,范广其,蒋经伟,周遵春. 2024

[14]海湾扇贝杂交、近交和自交家系的微卫星标记偏分离分析. 李莉,张守都,郑怀平,张国范. 2012

[15]三疣梭子蟹氧化磷酸化代谢在家系近交中的变化. 王竹青,任宪云,高保全,刘萍,李健,王磊. 2018

[16]养殖大鳞鲃发病死亡F_3个体的微卫星标记分析. 常玉梅,鲁翠云,苗建发,李崇文,梁利群. 2017

[17]基于Web的肉羊信息管理系统中亲缘系数及近交系数的程序设计与实现. 涂远璐,邹建香,白云峰,冯国兴. 2016

[18]如皋黄鸡选育群105日龄体重遗传力及近交参数分析. 郭军,王克华,曲亮,沈曼曼,窦套存,胡玉萍. 2015

[19]狼山鸡小群保种方法的后续效应观测. 苏一军,沈晓鹏,张学余. 2002

[20]中国10个地方猪种的群体近交程度分析. 王昕,陈宏,曹红鹤. 2006

作者其他论文 更多>>

微信小程序