百合LdGASA1基因克隆与生物信息学及表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李雪艳

作者： 李雪艳;胡新颖;白一光;王伟东;周俐宏;赵统利;杨迎东;刘威生

作者机构：

关键词： 百合;鳞茎发育;GASA基因;生物信息学分析;表达分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN：

年卷期： 2023 年 014 期

页码： 4579-4586

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究从百合小鳞茎发育不同阶段蛋白质组数据中，筛选出调控鳞茎发育的上调表达基因LdGASA1，对其进行克隆、生物信息学分析及表达分析。序列分析显示LdGASA1基因全长725 bp，编码区CDS序列为336 bp，编码111个氨基酸。结构域分析显示，LdGASA1第52至第111个氨基酸含有一个典型的GASA保守结构域。其理化性质分析显示，编码蛋白质理论等电点（pI）为9.1，不稳定系数为35.14，属于稳定的疏水性蛋白，亚细胞定位预测该蛋白最可能定位在细胞质中，其二级结构主要为无规则卷曲（65.86%）和α-螺旋（22.52%），另外含有少量延伸链（12.60）和β-折叠（9.01%）。通过RT-qPCR分析发现LdGASA1基因在小鳞茎出现前表达量相对较低，主要在小鳞茎形态建成和发育阶段表达，且在小鳞茎形态基本建成（35 d）时表达量达到最高。本研究结果为探索GASA基因调控百合生长发育的机制打下基础。

分类号： S682.29

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