草莓SBP基因家族生物信息学初步分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 葛安静

作者： 葛安静;张春华;董清华;赵密珍;宋长年;张希

作者机构：

关键词： 草莓;拟南芥;SBP基因家族;生物信息学

期刊名称： 中国农学通报

ISSN： 1000-6850

年卷期： 2012 年 28 卷 13 期

页码： 215-220

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了研究草莓SBP基因家族的功能,利用多种生物信息学软件,对SBP蛋白序列的系统发生和基因组定位进行分析,对其氨基酸组成成分、理化性质以及二、三级结构进行分析和预测等。结果表明草莓16条SBP蛋白序列与拟南芥16条SBP蛋白序列一起分成了3个亚族,说明拟南芥与草莓SBP基因间具有较高的保守性。基因组定位发现16个SBP基因分布在6条染色体上。研究还发现不同亚族间氨基酸数目、氨基酸序列间的疏水性存在一定的差异,而它们的二级结构主要以随机卷曲为主,三级结构相似。SBP基因家族在植物的生长、发育等多个方面起重要作用,笔者实验结果为草莓SBP基因家族的进一步功能分析提供了重要研究基础。

分类号： S668.4

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