30个马铃薯卷叶病毒CP基因序列分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 韩树鑫
作者: 韩树鑫;张俊华;白艳菊;张威;高艳玲;范国权;张抒;申宇
作者机构:
关键词: 马铃薯;卷叶病毒;CP基因;序列分析
期刊名称: 山东农业大学学报(自然科学版)
ISSN: 1000-2324
年卷期: 2016 年 47 卷 03 期
页码: 353-358
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 通过对含有PLRV的不同样品RT-PCR扩增,成功地克隆了PLRV CP基因,经比对样品的CP基因序列,核酸一致率为99.55%,仅发现了来自于广东的样品与其它样品有5个碱基的差异。试验样品与国内已报道的PLRV CP基因进行进化分析,不同地区的PLRV CP基因可分为A,B组,且有区域性特征。来自广东、云南及贵州的样品在两组中均有分布,但来自于内蒙古的样品仅聚类在A组。而中国样品与其他国家PLRV CP基因相比较,经进化树分组后,主要分为S1和S2两组,其中S1组中,包含了所有来自于我国的样品和绝大多数其它样品,且无规律可循;而S2组中的样品仅只来自于埃及和波兰。总体上,PLRV CP序列的差异仍然较小,因此,目前PLRV病毒的种群基因较稳定。
分类号: S432.41
- 相关文献
[1]马铃薯卷叶病毒CP基因的RT-PCR扩增. 何心凤,郭宝太,李广存,杨煜,王晓杰,毕玉平. 2007
[2]马铃薯卷叶病毒(PLRV)检测及系统进化关系的研究进展. 郑世玲,刘作易. 2007
[3]苹果茎沟病毒梨分离物外壳蛋白基因的克隆和序列分析. 郑银英,洪霓,王国平,胡红菊. 2006
[4]青海省部分地区马铃薯Y病毒cp基因序列分析. 程亮. 2019
[5]河北省藁城花生病毒病的 RT-PCR 检测及外壳蛋白基因序列分析. 康彦平,晏立英,雷永,廖伯寿. 2015
[6]江苏省葫芦科作物西瓜花叶病毒的分子鉴定和序列分析. 任春梅,程兆榜,缪倩,魏利辉,周益军,范永坚. 2013
[7]苹果茎痘病毒PCR检测及分子变异分析(摘要). 李丽丽,董雅凤,张志宏,张尊平,裴光前. 2009
[8]部分蔬菜CMV分离物CP基因的克隆及序列分析. 陈伟,罗静,庄木,李艳红,冯兰香,王晓武,谢丙炎,刘玉梅,方智远. 2006
[9]芝麻黄花叶病病原的分子鉴定. 晏立英,许泽永,廖伯寿. 2009
[10]海南胡椒中黄瓜花叶病毒分离物的分子鉴定. 牛立霞,王健华,冯团诚,刘志昕. 2008
[11]河北省藁城花生病毒病的RT-PCR检测及外壳蛋白基因序列分析. 康彦平,晏立英,雷永,廖伯寿. 2015
[12]侵染落葵的黄瓜花叶病毒分离物CP基因序列分析. 牛立霞,牛胜鸟,王健华,刘志昕. 2008
[13]花生条纹病毒(红安分离物)cp基因的克隆和序列分析. 晏立英,许泽永,陈坤荣. 2007
[14]卷叶病毒对葡萄叶片光合活性影响的初测. 王国珍,李淑华,麻冬梅,樊仲庆,马金平. 2005
[15]葡萄卷叶病病原研究. 李知行,郭德银,冯桂馨,蒯传化,张秋叶. 1992
[16]马铃薯StNAC72基因克隆及表达分析. 巩檑,甘晓燕,张丽,陈虞超,聂峰杰. 2016
[17]马铃薯PGA1基因的克隆及序列分析. 闫建俊,白云凤,左静静,裴成成,左敏. 2019
[18]致病疫霉菌无毒基因AVR3a的克隆与序列分析. 兰成忠,陈庆河,汪进仕,胡方平,李本金,赵健,邱荣洲,翁启勇. 2008
[19]StSRK2E-like基因的序列分析及表达载体构建. 冯月娟,李荣,王芳. 2022
[20]马铃薯S病毒外壳蛋白基因的克隆及其在大肠杆菌中的表达. 李广存,杨煜,王秀丽,杨元军,毕玉平. 2004
作者其他论文 更多>>
-
丹系大白猪与亚洲野猪全基因组选择信号分析
作者:吴旭东;刘孟全;李默;张威;吴涛;赵子龙;殷宗俊
关键词:丹系大白猪;亚洲野猪;全基因组重测序;选择清除;候选基因
-
黟县黑猪微卫星遗传多样性分析
作者:李雪婷;董林;王重龙;刘林清;张威;苏世广;周学利;周梅
关键词:黟县黑猪;微卫星标记;遗传多样性;聚丙烯酰胺凝胶电泳
-
大豆籽粒Ve含量的全基因组关联分析
作者:张红梅;张威;王琼;贾倩茹;孟珊;熊雅文;刘晓庆;陈新;陈华涛
关键词:大豆;籽粒;Ve含量;全基因组关联分析;候选基因
-
甲基磺酸乙酯(EMS)对谷子种子及幼苗活力的影响
作者:闫锋;董扬;赵富阳;侯晓敏;李清泉;王冰雪;周超;杨慧莹;范国权;刘凯
关键词:谷子;种子萌发;幼苗生长;甲基磺酸乙酯(EMS)
-
基于RNA-Seq技术对不同品种猪排卵前卵泡差异表达基因的筛选与注释
作者:刘林清;李庆岗;苏世广;周梅;张威;王重龙
关键词:淮猪;大约克猪;RNA-Seq;差异表达基因
-
大豆叶型性状全基因组关联分析与候选基因鉴定
作者:王琼;朱宇翔;周密密;张威;张红梅;陈新;陈华涛;崔晓艳
关键词:大豆;叶型;异形叶;全基因组关联分析;SNP标记
-
大豆铝激活苹果酸转运家族基因GmALMT8的鉴定与功能验证
作者:刘慧;许文静;张红梅;刘晓庆;张威;王琼;朱月林;陈华涛
关键词:菜用大豆;苹果酸;候选基因;功能分析