玉米籽粒氮含量遗传位点挖掘及候选基因预测

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王利锋

作者： 王利锋;王森;蔡齐宗;王浩;周柯;杨继伟;李晶晶;贾腾蛟;张站壹;王景;李会勇

作者机构： 河南省农业科学院农作物种质资源研究所

关键词： 玉米;籽粒;氮含量;全基因组关联分析;候选基因

期刊名称： 植物遗传资源学报

ISSN： 1672-1810

年卷期： 2024 年 25 卷 009 期

页码： 1540-1551

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 玉米籽粒氮含量与品质紧密相关,其遗传机制的解析对玉米品质育种具有重要意义.本研究以252份玉米自交系为关联群体,利用贝叶斯信息与连锁不平衡迭代嵌套式模型(BLINK,bayesian-information and linkage-disequilibrium iteratively nested keyway)、固定随机循环概率模型(FarmCPU,fixed and random model circulating probability unification)、一般线性模型(GLM,general linear model)、混合线性模型(MLM,mixed linear model)、多位点混合线性模型(MLMM,multiple loci mixed model)和逐步排它性混合线性模型(SUPER,settlement of MLM under progressively exclusive relationship)等方法分别对其籽粒氮含量进行全基因组关联分析.共鉴定到13个与籽粒氮含量显著关联的SNP(P<3.64E-07)o BLINK、FarmCPU、GLM、MLM、MLMM和SUPER方法分别检测到6个、3个、7个、4个、2个和4个SNP位点.其中,S3 8879213在5种方法中均能检测到,S9_146173702在4种方法中均能检测到,S5 114774030和S7_182217338在3种方法中均能检测到,S1_10906326和S1_177528813在2种方法中均能检测到.共挖掘25个相关候选基因,其中Zm00001eb275080和Zm00001eb330700可能是影响玉米籽粒氮含量的重要候选基因.

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