猕猴桃MYB家族成员鉴定及其低温表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 毛可欣

作者： 毛可欣;安淼;王海荣;王世金;吕巍;郭盈添;李健;李国田

作者机构：

关键词： 猕猴桃;MYB家族;密码子偏好性;低温胁迫;表达

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2023 年 003 期

页码： 534-548

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 通过对‘红阳’猕猴桃基因组鉴定得到277个MYB家族成员并将其分为12个亚家族（S1～S12），其中多数序列属于R2R3-MYB，其次是MYB相关蛋白，仅鉴定到1个4R-MYB。S11和S12亚家族在进化上处于较早的位置，结构较为多样化，而S1和S2在进化上出现较晚。顺式作用元件分析显示，该家族主要含水杨酸、赤霉素和茉莉酸甲酯等相关植物激素元件，还有部分参与昼夜节律、低温、细胞周期等相关元件。密码子偏好性分析显示，猕猴桃MYB家族有3个高频密码子（UUG、AGA和AGG），基因的密码子偏好使用A/T，第3位碱基偏好更强。通过顺式作用元件分析和4个猕猴桃品种越冬期转录组数据分析筛选了9个可能参与低温胁迫响应MYB基因，对其在低温胁迫下的软枣猕猴桃‘龙成2号’中进行检测验证，确认这些基因参与猕猴桃对低温的响应。

分类号： S663.4

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