口蹄疫病毒株China/99L区段核苷酸序列测定及比较分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张显升

作者： 张显升;赵启祖;刘在新;刘相涛;常惠芸;江鹏斐;陈应理;李冬;魏怀录;谢庆阁

作者机构：

关键词： 口蹄疫病毒;L基因;序列比较分析

期刊名称： 中国病毒学

ISSN： 1003-5125

年卷期： 2002 年 02 期

页码：

收录情况： CSCD

摘要： 以口蹄疫病毒株China/ 99RNA为模板 ,反转录并扩增目的cDNA ,然后与 pGEM TEasy载体连接并转化JM10 9菌株 ,提取的重组质粒用电泳、PCRampos和EcoR1酶切法鉴定。该毒株与A10、O1K、O1Campos和TW 45毒株的核苷酸序列差异率分别为 15 .2 7%、15 .5 6 %、15 .5 6 %和 15 .49% ;氨基酸序列差异率分别为 8.2 9%、8.76 %、9.2 2 %和 10 .14%。五个毒株的L/P1连接处均为苷氨酸 (Gly) /异亮氨酸 (Ile)。序列比较表明 ,T C、A G和A C转换率较高 ,是点突变的热点核苷酸 ,是影响氨基酸稳定的因素之一。第 43 5 3、95 10 5、10 8 111、146 15 3、16 1 173、183 188和 182 187区域极有可能是L蛋白酶的活性中心 ,第 48位的H、5 1的C、6 5位的E、95位的H、10 9位的H、138位的H、148位的H和 16 5位的E可能是L蛋白酶的活性位点 ,它们在维持蛋白质的空间构像和功能方面具有重要作用

分类号： S852.65

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